More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1420 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1420  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  55.93 
 
 
244 aa  265  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  55.08 
 
 
244 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  51.26 
 
 
240 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0208  ABC transporter related protein  51.46 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0617  ABC transporter related  50 
 
 
243 aa  228  6e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.854528 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  47.01 
 
 
243 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0214  ABC transporter related  44.98 
 
 
234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0225  ABC transporter related  43.67 
 
 
245 aa  192  3e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1322  ABC transporter related  42.79 
 
 
245 aa  190  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  44.81 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  44.81 
 
 
310 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  39.24 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  46.45 
 
 
310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  45.12 
 
 
316 aa  178  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
305 aa  178  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.4 
 
 
243 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  39.91 
 
 
337 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  40.79 
 
 
240 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  45.54 
 
 
303 aa  175  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  40.76 
 
 
244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
256 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  34.17 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.2 
 
 
318 aa  169  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.21 
 
 
241 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  39.5 
 
 
244 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  39.08 
 
 
244 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  34.17 
 
 
257 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  37.82 
 
 
244 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  41.07 
 
 
308 aa  168  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  38.75 
 
 
244 aa  168  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  39.08 
 
 
244 aa  168  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  38.72 
 
 
244 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  39.5 
 
 
244 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 
321 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  41.51 
 
 
318 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  38.24 
 
 
244 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  38.24 
 
 
244 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  40.95 
 
 
250 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  38.24 
 
 
244 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  38.39 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  38.3 
 
 
244 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  38.3 
 
 
244 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.73 
 
 
339 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  40.09 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  34.35 
 
 
246 aa  164  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  164  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  164  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  35.87 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  39.75 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  35.87 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.87 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.25 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.37 
 
 
332 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.07 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.33 
 
 
279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  37.34 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  36.78 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  40 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  37.82 
 
 
244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.37 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
310 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  42.18 
 
 
304 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  37.39 
 
 
244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
356 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  33.47 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  33.62 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  37.05 
 
 
306 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
318 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  35.95 
 
 
251 aa  161  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  41.07 
 
 
337 aa  161  7e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
868 aa  161  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.35 
 
 
334 aa  161  7e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.17 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
309 aa  161  9e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  37.9 
 
 
339 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.44 
 
 
316 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.93 
 
 
249 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  33.88 
 
 
259 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  37.56 
 
 
337 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4872  ABC transporter related  37.56 
 
 
339 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  38.53 
 
 
337 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  36.48 
 
 
318 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.45 
 
 
312 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  39.27 
 
 
344 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  40 
 
 
273 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  35.22 
 
 
321 aa  158  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.98 
 
 
309 aa  158  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
318 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  38.07 
 
 
337 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.18 
 
 
320 aa  158  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  38.46 
 
 
331 aa  158  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  37.34 
 
 
248 aa  158  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
341 aa  158  8e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  43.6 
 
 
301 aa  158  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
315 aa  158  8e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  36.49 
 
 
295 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>