More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0389 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  51.24 
 
 
877 aa  859    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  49.44 
 
 
876 aa  821    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  51.19 
 
 
876 aa  854    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  51.36 
 
 
877 aa  863    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  100 
 
 
880 aa  1799    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  51.58 
 
 
877 aa  870    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  51.13 
 
 
891 aa  860    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  51.24 
 
 
891 aa  861    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  51.24 
 
 
891 aa  861    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  49.11 
 
 
876 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  42.91 
 
 
879 aa  679    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  52.57 
 
 
888 aa  881    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  51.13 
 
 
877 aa  860    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  42.39 
 
 
888 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.33 
 
 
885 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  49.11 
 
 
876 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  51.24 
 
 
877 aa  862    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  51.24 
 
 
877 aa  862    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  42.29 
 
 
894 aa  655    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  45.58 
 
 
895 aa  742    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  43.56 
 
 
866 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  43.56 
 
 
866 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  51.86 
 
 
878 aa  867    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  41.93 
 
 
872 aa  639    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  41.62 
 
 
866 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  51.13 
 
 
877 aa  860    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  67.27 
 
 
877 aa  1206    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  48.43 
 
 
903 aa  812    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  53.77 
 
 
896 aa  936    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  50.11 
 
 
893 aa  841    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  77.05 
 
 
879 aa  1395    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  51.13 
 
 
877 aa  860    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  42.02 
 
 
883 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  42.71 
 
 
870 aa  634  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  41.69 
 
 
873 aa  622  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  40.95 
 
 
896 aa  611  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  42.92 
 
 
850 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  40.97 
 
 
868 aa  598  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  40.52 
 
 
892 aa  597  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  39.51 
 
 
878 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.47 
 
 
891 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.97 
 
 
891 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  37.93 
 
 
902 aa  567  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.23 
 
 
892 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.02 
 
 
906 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  38.98 
 
 
908 aa  561  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.78 
 
 
888 aa  561  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  39.51 
 
 
911 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  37.16 
 
 
878 aa  557  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  39.67 
 
 
892 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.53 
 
 
928 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  36.97 
 
 
901 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.73 
 
 
924 aa  554  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.65 
 
 
909 aa  555  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.89 
 
 
893 aa  550  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  37.62 
 
 
936 aa  550  1e-155  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.77 
 
 
920 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.77 
 
 
920 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.75 
 
 
908 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.51 
 
 
945 aa  548  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  35.94 
 
 
902 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.48 
 
 
929 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.58 
 
 
933 aa  545  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.46 
 
 
903 aa  545  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.64 
 
 
893 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.23 
 
 
903 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  37.51 
 
 
910 aa  543  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.38 
 
 
885 aa  543  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  36.04 
 
 
895 aa  542  9.999999999999999e-153  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.27 
 
 
926 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.88 
 
 
899 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  37.24 
 
 
904 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.66 
 
 
912 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  36.25 
 
 
899 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.78 
 
 
884 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.91 
 
 
893 aa  534  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  38.11 
 
 
928 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  37.66 
 
 
912 aa  533  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  36.43 
 
 
897 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.69 
 
 
934 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.45 
 
 
911 aa  532  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  36.69 
 
 
897 aa  532  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.06 
 
 
917 aa  530  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  37 
 
 
935 aa  529  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  36.32 
 
 
897 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  38.52 
 
 
926 aa  528  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  37.03 
 
 
901 aa  528  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  38.23 
 
 
928 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  37.46 
 
 
928 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  36.11 
 
 
911 aa  523  1e-147  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  36.84 
 
 
905 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  37.46 
 
 
915 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.91 
 
 
893 aa  525  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  36.67 
 
 
888 aa  522  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.73 
 
 
930 aa  520  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  36.79 
 
 
929 aa  522  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  37.95 
 
 
921 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  37.95 
 
 
921 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  37.95 
 
 
935 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  36.26 
 
 
904 aa  521  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>