241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1343 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
522 aa  975    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  45.77 
 
 
329 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  34.8 
 
 
334 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
419 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
250 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
390 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.79 
 
 
342 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 
418 aa  94.4  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 
386 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
227 aa  94  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40 
 
 
343 aa  92.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  36.03 
 
 
369 aa  92.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
324 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
219 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.43 
 
 
325 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
335 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
386 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
386 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
316 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.32 
 
 
335 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.74 
 
 
217 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
372 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  37.04 
 
 
315 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  32.88 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  35.57 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.46 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
364 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  36.62 
 
 
321 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  39.31 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  31.56 
 
 
312 aa  77  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  35.26 
 
 
299 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
224 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.01 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.55 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.55 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  29.55 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.19 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  40.8 
 
 
330 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
268 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
219 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
302 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  30.07 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  33.49 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
234 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 
807 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
223 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
232 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
218 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
270 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  40.18 
 
 
236 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  30.19 
 
 
243 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
217 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
367 aa  60.1  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
235 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
304 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
218 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.52 
 
 
253 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7707  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
889 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  33.81 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
253 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
247 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 
1115 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  25.76 
 
 
253 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
374 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 
357 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
270 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.76 
 
 
193 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
417 aa  56.2  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
284 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
343 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
279 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  25.95 
 
 
253 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 
253 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
418 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
425 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.95 
 
 
253 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.25 
 
 
410 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
300 aa  54.7  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  24.18 
 
 
479 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.21 
 
 
309 aa  54.7  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  34.53 
 
 
410 aa  54.7  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  32.4 
 
 
393 aa  54.3  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  32.54 
 
 
259 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  26.5 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  31.5 
 
 
708 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
225 aa  53.5  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
239 aa  53.5  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 
479 aa  53.5  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>