More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1216 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  50.38 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  48.85 
 
 		 133 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  43.94 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  49.61 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  41.67 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  46.97 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  50.77 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  44.62 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  44.7 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  44.53 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  50.81 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  41.22 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  43.41 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  42.97 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  50.78 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  48.78 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  45.31 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  39.23 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  48.48 
 
 		 131 aa  123  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  43.94 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  46.56 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  45.67 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  48.15 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  43.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  40.91 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  51.85 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  51.85 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  41.54 
 
 		 132 aa  118  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  42.97 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  42.52 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  47.86 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  44.17 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  42.75 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  41.22 
 
 		 130 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  40.46 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  41.41 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  41.67 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  41.73 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  43.59 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  43.97 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  40.91 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  42.75 
 
 		 131 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  40.91 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  36.51 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  40.62 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  42.19 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  40.46 
 
 		 133 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  44.63 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  45.24 
 
 		 132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  39.84 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  45.93 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  44.44 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  38.35 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  39.1 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  36.22 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  42.06 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.17 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  39.68 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  39.23 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  37.3 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  39.71 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  37.4 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  31.11 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  32.33 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  37.01 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  36.51 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  32.84 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  35.04 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  34.38 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  34.92 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  35.88 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  37.24 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  37.5 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  38.97 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  32.84 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  31.58 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  29.71 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  35.34 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  31.85 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  36.75 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  35.48 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  32.37 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  33.83 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  33.58 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  39.13 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  32.33 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>