123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3607 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3607  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  795    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2156  protein of unknown function DUF453  40.94 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.738715 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1266  hypothetical protein  45.33 
 
 		 384 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4264  hypothetical protein  43.43 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.471558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3941  hypothetical protein  42.04 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0497  hypothetical protein  41.32 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3889  hypothetical protein  39.47 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4311  protein of unknown function DUF453  40.83 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4989  hypothetical protein  42.74 
 
 		 386 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0792  hypothetical protein  39.78 
 
 		 350 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.533425  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2873  protein of unknown function DUF453  39.78 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200218  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0796  hypothetical protein  39.78 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.872175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2893  hypothetical protein  39.78 
 
 		 350 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.210089 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2588  hypothetical protein  39.78 
 
 		 350 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0873  hypothetical protein  39.78 
 
 		 350 aa  239  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0823  hypothetical protein  39.51 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2818  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  40.05 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0174979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31290  FldA-like protein  41.76 
 
 		 360 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03236  FldA  41.51 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3209  hypothetical protein  38.48 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1048  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  39.32 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3205  hypothetical protein  41.89 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2090  hypothetical protein  40.63 
 
 		 363 aa  232  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2513  hypothetical protein  41.62 
 
 		 361 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2088  hypothetical protein  38.73 
 
 		 396 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.751396  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0163  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.83 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1360  hypothetical protein  37.21 
 
 		 363 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0328  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  40.05 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0480492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2026  hypothetical protein  40.43 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1912  hypothetical protein  38.38 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0107057  normal  0.39316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0988  hypothetical protein  37.87 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.375128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02394  hypothetical protein  36.92 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2290  hypothetical protein  36.67 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.099053  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5177  protein of unknown function DUF453  37.33 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.841395  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3577  hypothetical protein  39.3 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353102  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0955  putative AcnD-accessory protein PrpF  37.11 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1574  hypothetical protein  40.11 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346083  normal  0.58422 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003391  PrpF protein involved in 2-methylcitrate cycle  36.83 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3805  hypothetical protein  39.95 
 
 		 707 aa  222  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.245031  normal  0.613822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1269  hypothetical protein  40.16 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0878  hypothetical protein  37.33 
 
 		 372 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393363 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3972  AcnD-accessory protein PrpF  36.99 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.222737 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3858  AcnD-accessory protein PrpF  36.99 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4551  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  38.27 
 
 		 684 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2033  hypothetical protein  36.53 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3163  hypothetical protein  38.92 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3632  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.81 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.96 
 
 		 698 aa  216  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2055  hypothetical protein  40.48 
 
 		 359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1811  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.87 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0299  hypothetical protein  39.36 
 
 		 375 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.216754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3706  hypothetical protein  38.26 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0396378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3362  protein of unknown function DUF453  37.47 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05387  DUF453 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00360)  39.95 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.328727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1823  putative AcnD-accessory protein PrpF  33.85 
 
 		 389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.458437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2186  AcnD-accessory protein PrpF  36.68 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0342  hypothetical protein  35.46 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0312  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.55 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3685  hypothetical protein  39.84 
 
 		 370 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03003  hypothetical protein  36.48 
 
 		 396 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2602  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  36.53 
 
 		 392 aa  212  9e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000005222  hitchhiker  0.0000122233 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1879  hypothetical protein  31.08 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3828  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.81 
 
 		 397 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3647  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.85 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1867  hypothetical protein  35.96 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1739  AcnD-accessory protein PrpF  35.96 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0876  hypothetical protein  35.96 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1163  hypothetical protein  35.96 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0385  AcnD-accessory protein PrpF  35.96 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.957828  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2140  hypothetical protein  35.96 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0291  AcnD-accessory protein PrpF  35.96 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4451  hypothetical protein  35.34 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1938  AcnD-accessory protein PrpF  35.96 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000190692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6709  AcnD-accessory protein PrpF  36.62 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2496  AcnD-accessory protein PrpF  35.38 
 
 		 405 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.945381  hitchhiker  0.00398819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3948  AcnD-accessory protein PrpF  34.68 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4050  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.68 
 
 		 407 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1633  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  37.22 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  0.162569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4725  hypothetical protein  36.15 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2081  AcnD-accessory protein PrpF  37.22 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3290  AcnD-accessory protein PrpF  35.99 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1584  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  34.64 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00480301  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4143  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.43 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3586  AcnD-accessory protein PrpF  36.34 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716521  normal  0.0110603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53980  hypothetical protein  35.9 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2083  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.82 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327922  normal  0.0837253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4758  AcnD-accessory protein PrpF  35.99 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680432  normal  0.849892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2300  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  33.76 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.763131  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4025  protein of unknown function DUF453  38.28 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425768  normal  0.0966594 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1778  AcnD-accessory protein PrpF  35.48 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152698  hitchhiker  0.00100052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0144  methylitaconate delta2-delta3-isomerase  35.73 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2337  hypothetical protein  34.98 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.634826  hitchhiker  0.0000401834 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5347  PrpF, AcnD-accessory  35.73 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5514  putative AcnD-accessory protein PrpF  35.73 
 
 		 396 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.205099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3433  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.73 
 
 		 396 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0190696  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4024  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.18 
 
 		 407 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1667  PrpF, AcnD-accessory  35.1 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.870319  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2319  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.41 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1860  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.63 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1663  putative AcnD-accessory protein PrpF  34.97 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>