More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3657 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3657  methionine synthase  100 
 
 		 342 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15726 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3347  methionine synthase (B12-dependent)  88.86 
 
 		 359 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2998  methionine synthase  88.86 
 
 		 359 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639431  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3617  methionine synthase (B12-dependent)  79.07 
 
 		 349 aa  558  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732066  normal  0.0126884 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  78.13 
 
 		 1250 aa  544  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0328  B12-dependent methionine synthase  72.4 
 
 		 1264 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2911  B12-dependent methionine synthase  73.59 
 
 		 1257 aa  500  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2966  B12-dependent methionine synthase  73.57 
 
 		 1257 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2651  B12-dependent methionine synthase  73.43 
 
 		 1257 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0188  B12-dependent methionine synthase  73.43 
 
 		 1261 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0182  B12-dependent methionine synthase  73.13 
 
 		 1261 aa  481  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2870  B12-dependent methionine synthase  71.94 
 
 		 1257 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0197  B12-dependent methionine synthase  70.45 
 
 		 1263 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  68.58 
 
 		 1247 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4918  B12-dependent methionine synthase  69.67 
 
 		 1248 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  68.07 
 
 		 1271 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2123  B12-dependent methionine synthase  68.42 
 
 		 1250 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607854 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1638  B12-dependent methionine synthase  67.18 
 
 		 1250 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  67.49 
 
 		 1250 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  67.49 
 
 		 1250 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3545  B12-dependent methionine synthase  66.36 
 
 		 1245 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.229259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  64.83 
 
 		 1293 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  65.05 
 
 		 1245 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  63.69 
 
 		 1246 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2732  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  63.38 
 
 		 1239 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0346659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  65.02 
 
 		 1235 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2464  B12-dependent methionine synthase  62.77 
 
 		 1239 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.782684  normal  0.0191622 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  65.02 
 
 		 1235 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3735  B12-dependent methionine synthase  64.31 
 
 		 1286 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.391435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  63.69 
 
 		 1278 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  60.91 
 
 		 1228 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2159  B12-dependent methionine synthase  64.09 
 
 		 1236 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.088857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40670  B12-dependent methionine synthase  64.4 
 
 		 1234 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0754274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3107  B12-dependent methionine synthase  63.08 
 
 		 1236 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  64.09 
 
 		 1235 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3449  B12-dependent methionine synthase  64.09 
 
 		 1234 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1764  B12-dependent methionine synthase  62.76 
 
 		 1304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.075059  normal  0.0106397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  62.39 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3541  B12-dependent methionine synthase  65.67 
 
 		 1293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0988023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1888  B12-dependent methionine synthase  64.6 
 
 		 1235 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2402  homocysteine S-methyltransferase  61.77 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.264872  normal  0.0639264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0872  B12-dependent methionine synthase  58.26 
 
 		 1238 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  62.61 
 
 		 1250 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  62.31 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  57.26 
 
 		 1262 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  60.73 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  62.31 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  59.51 
 
 		 1244 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1689  homocysteine S-methyltransferase  62.39 
 
 		 354 aa  401  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  61.77 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1545  B12-dependent methionine synthase  60.99 
 
 		 1237 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.396086  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1030  B12-dependent methionine synthase  59.69 
 
 		 1244 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  61.4 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  61.4 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  61.92 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0838  B12-dependent methionine synthase  58.9 
 
 		 1244 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3184  B12-dependent methionine synthase  58.9 
 
 		 1244 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0191  homocysteine S-methyltransferase  61.77 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  61.4 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  59.2 
 
 		 1244 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  61.09 
 
 		 367 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0606  B12-dependent methionine synthase  60.54 
 
 		 1232 aa  394  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0283  B12-dependent methionine synthase  64.92 
 
 		 1290 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.383841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  60.49 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7061  B12-dependent methionine synthase  64.2 
 
 		 1287 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  61.47 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  61.89 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  57.98 
 
 		 1244 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.98 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  58.28 
 
 		 1244 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  61.52 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  60.24 
 
 		 351 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  58.28 
 
 		 1233 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  59.15 
 
 		 1226 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  58.08 
 
 		 1226 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3207  methionine synthase (B12-dependent)  55.98 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  62.69 
 
 		 1226 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  58.46 
 
 		 1244 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1980  methionine synthase  60.61 
 
 		 354 aa  393  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0758  B12-dependent methionine synthase  59.69 
 
 		 1246 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.659122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  59.88 
 
 		 1236 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  60.49 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.49 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0083  methionine synthase (B12-dependent)  60.88 
 
 		 366 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  59.41 
 
 		 1237 aa  389  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.49 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  58.64 
 
 		 1228 aa  388  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  57.19 
 
 		 1225 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0172  B12-dependent methionine synthase  57.86 
 
 		 1239 aa  388  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.432955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3799  methionine synthase  59.38 
 
 		 1219 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.49 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  58.11 
 
 		 1245 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.49 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  60.49 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  61.47 
 
 		 339 aa  388  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  61.09 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  57.49 
 
 		 1232 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  58.07 
 
 		 1226 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  56.98 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0595  B12-dependent methionine synthase  56.16 
 
 		 1272 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>