224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3647 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  100 
 
 		 292 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  81.75 
 
 		 285 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  40.75 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  31.62 
 
 		 288 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  32.43 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  29.23 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  29.23 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  29.23 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  29.23 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  29.23 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  29.23 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  29.23 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  31.92 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  30.6 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3872  PfkB domain protein  24.64 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3914  PfkB domain-containing protein  24.73 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  28.43 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  27.52 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3975  PfkB domain-containing protein  24.37 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.971364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3806  PfkB domain protein  24.37 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3794  PfkB domain protein  24.37 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  31.92 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3563  PfkB domain protein  29.87 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  28.32 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  25.87 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  24.62 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  27.18 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  22.96 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  22.88 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  30.21 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  23.99 
 
 		 317 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  27.96 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3688  PfkB domain protein  25.97 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.03 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  25.93 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  26.6 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  20.41 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2720  PfkB domain protein  25.9 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5137  PfkB domain protein  28.69 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  26.83 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  23.28 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  27.65 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  25.48 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  24.07 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1193  PfkB domain protein  23.95 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.8184  normal  0.176819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.17 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2162  PfkB domain protein  29.05 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0183703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  27.73 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.26 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  25.48 
 
 		 319 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  27.34 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  40 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0205  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.03 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  24.12 
 
 		 313 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0423  PfkB domain protein  27.51 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  23.6 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0649  ribokinase-like domain-containing protein  24.65 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0225975  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  22.78 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6168  PfkB domain protein  29.12 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  hitchhiker  0.00391077 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  30.3 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4286  putative carbohydrate kinase  27.51 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.27 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  30.65 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  26.29 
 
 		 320 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  27.54 
 
 		 308 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0462  kinase, PfkB family  38.57 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.27 
 
 		 298 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  24.48 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  25.72 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  22.61 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  30.74 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0545  ribokinase-like domain-containing protein  43.08 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4169  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  26.21 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  22.61 
 
 		 333 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  27.65 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0221  PfkB domain protein  32 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.349538  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  30.31 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  23.31 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  22.74 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  22.95 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  27.24 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  37.88 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  41.86 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  32.95 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  28.17 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  22.14 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  36.19 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>