More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1863 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  100 
 
 		 195 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  52.9 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  56.86 
 
 		 162 aa  184  7e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  53.21 
 
 		 158 aa  174  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  49.02 
 
 		 161 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  51.61 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  45.36 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 188 aa  157  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  46.24 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 193 aa  154  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  48.21 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  48.7 
 
 		 212 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  47.44 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  54.93 
 
 		 231 aa  150  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  52.08 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  47.74 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  54.93 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  46.15 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  45.81 
 
 		 160 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.05 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  49.67 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  47.1 
 
 		 161 aa  147  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  46.2 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  50.3 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  45.81 
 
 		 160 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  42.86 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  45.57 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  47.77 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  43.72 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  48.34 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  46.5 
 
 		 159 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 161 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  48.03 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  40.8 
 
 		 169 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  50 
 
 		 164 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  45.81 
 
 		 160 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 168 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.3 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  45.81 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  48.7 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  50 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  45.86 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  45.81 
 
 		 160 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  50.7 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  45.75 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  46.45 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  49.32 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  42.41 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  47.74 
 
 		 163 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  52.31 
 
 		 195 aa  141  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  42.47 
 
 		 164 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 163 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  50.69 
 
 		 161 aa  141  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  49.29 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 158 aa  141  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 161 aa  141  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  45.89 
 
 		 165 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  43.95 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  45.16 
 
 		 160 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  45.28 
 
 		 164 aa  140  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  42.41 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  48.61 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  45.03 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  42.04 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  45.25 
 
 		 192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  41.77 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  43.23 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  40.76 
 
 		 158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  49.29 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  50.7 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  41.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  44.79 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  47.92 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 161 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  41.14 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>