204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2154 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1830  HpcH/HpaI aldolase  94.48 
 
 		 326 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.650441 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2154  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 326 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1999  lyase protein  91.85 
 
 		 320 aa  587  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2490  HpcH/HpaI aldolase  75.69 
 
 		 326 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.33076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2328  putative citrate lyase beta subunit  75.08 
 
 		 326 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4357  HpcH/HpaI aldolase  60.49 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6859  HpcH/HpaI aldolase  59.57 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  normal  0.224007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2899  lyase  60.19 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2868  malyl-CoA lyase or citrate lyase, beta subunit  58.46 
 
 		 327 aa  384  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4429  Citrate lyase subunit beta-like protein  58.59 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00516467  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4148  putative citrate lyase  57.1 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2553  HpcH/HpaI aldolase  57.54 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.108107  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4436  HpcH/HpaI aldolase  58.64 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3931  HpcH/HpaI aldolase  58.64 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3597  HpcH/HpaI aldolase  58.64 
 
 		 335 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4731  HpcH/HpaI aldolase  55.28 
 
 		 334 aa  358  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0657  lyase, putative  57.41 
 
 		 339 aa  354  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2155  citrate lyase beta subunit-like  58.95 
 
 		 335 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1618  putative lyase  57.72 
 
 		 339 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1826  putative lyase  57.72 
 
 		 339 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2475  putative lyase  57.72 
 
 		 339 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2337  putative lyase  57.72 
 
 		 339 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0496  putative lyase  57.72 
 
 		 339 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3824  HpcH/HpaI aldolase  58.95 
 
 		 334 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3308  HpcH/HpaI aldolase  58.95 
 
 		 334 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.747689 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1752  putative lyase  57.68 
 
 		 331 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4652  HpcH/HpaI aldolase  58.02 
 
 		 335 aa  340  1e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2208  HpcH/HpaI aldolase  54.41 
 
 		 341 aa  321  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0797  putative lyase  57.29 
 
 		 307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2173  putative lyase  52.13 
 
 		 337 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2709  putative lyase  50.9 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1804  putative citrate lyase beta subunit  49.13 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0637103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2431  HpcH/HpaI aldolase  51.4 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  49.24 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2279  HpcH/HpaI aldolase  51.52 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2789  HpcH/HpaI aldolase  51.52 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.175467  normal  0.257367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3029  HpcH/HpaI aldolase  49.09 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1434  HpcH/HpaI aldolase  48.17 
 
 		 332 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  29.07 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  29.59 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.71 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  31.97 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.71 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  30.25 
 
 		 318 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  30.11 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  31.33 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  31.67 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  31.16 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  31.16 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  31.16 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.3 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  30.41 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  30.18 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  31.77 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  30.31 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  27.84 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  29.97 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  33.46 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  25.6 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  28.72 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  32.6 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  27.43 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  33.08 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  27.24 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  26.12 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  31.65 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  27.1 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  25.78 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  35.45 
 
 		 276 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  33.97 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  27.08 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  27.43 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  27.27 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  30.4 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  30.38 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  29.79 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  26.97 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  26.57 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  27.47 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  28.93 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  25.88 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  25.32 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  27.62 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  28.97 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  28.36 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  29.64 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  29.71 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  31.23 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  29.64 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  23.62 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  23.62 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  30.46 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  27.76 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  29.34 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  24.15 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  24.15 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  29.13 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  23.66 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  28.46 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  28.63 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>