216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3626 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  67.78 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  36.09 
 
 		 275 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  32.35 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  30.38 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  37.02 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  34.29 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  31.3 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  29.01 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  31.58 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  34.52 
 
 		 349 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  34.52 
 
 		 349 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  31.94 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  30.37 
 
 		 335 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  27.57 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  28.46 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  26.79 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  28.69 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  30.16 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  27.16 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  30.3 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2757  hypothetical protein  29.27 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140498 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  29.05 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  27.56 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  25.65 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  32.24 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  31 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  32.24 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  30.5 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  30.5 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  28.63 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  30.94 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  27.8 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  30.94 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  27.52 
 
 		 729 aa  59.3  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3243  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.69 
 
 		 824 aa  58.9  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.656974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  29.55 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  27.68 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  28.57 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  25.93 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  22.76 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  28.43 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  25.42 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.43 
 
 		 653 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  35.4 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2269  putative dienelactone hydrolase  25.38 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  25.27 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  27.69 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  22.75 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  27.33 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  23.73 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  22.75 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  22.75 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  25.13 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  27 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  29.02 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  26.47 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  25.94 
 
 		 264 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  25.65 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  24.58 
 
 		 261 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  30.18 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  24.68 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  25.91 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  27.71 
 
 		 239 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  27.53 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  23.87 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  28.71 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  21.98 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  26.7 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  25.38 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  27.16 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2602  carboxymethylenebutenolidase  26.09 
 
 		 244 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.75 
 
 		 822 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  25.85 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.1 
 
 		 638 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  24.48 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  26.32 
 
 		 295 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  22.22 
 
 		 638 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  21.51 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  23.88 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  26.38 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  31.82 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.73 
 
 		 677 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  23.05 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  31.82 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  23.31 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  26.21 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>