More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1870 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1870  response regulator receiver protein  100 
 
 		 167 aa  338  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1493  response regulator receiver  82.39 
 
 		 166 aa  226  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3805  response regulator receiver domain-containing protein  67.66 
 
 		 167 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3857  response regulator receiver domain-containing protein  81.76 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0529  putative response regulator receiver protein  61.76 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4802  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0517  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  33.88 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355984  normal  0.550913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4061  putative response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.164869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7676  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.21 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3853  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  37.84 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3799  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  36.97 
 
 		 415 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 551 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1479  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 445 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1016  two component Fis family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 490 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0838008  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 404 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1876  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  36.52 
 
 		 416 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1496  response regulator and cylclic diguanylate phosphodiesterase  36.52 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 1356 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 		 642 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  35 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  35 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.48 
 
 		 461 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 265 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0247  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  35.8 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2171  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  32.23 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.189433  normal  0.293545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  34.57 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  28.83 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  31.67 
 
 		 548 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.01 
 
 		 552 aa  54.3  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 675 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.18 
 
 		 361 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0318  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  28.57 
 
 		 927 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 737 aa  53.9  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 829 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 991 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4779  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.77 
 
 		 494 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3227  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.30627  normal  0.696337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1202  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.61 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1940  response regulator  28.33 
 
 		 397 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249901  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0418  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 123 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.22885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  35.9 
 
 		 598 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 768 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.1 
 
 		 364 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2506  sensory box protein/sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.73 
 
 		 564 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2245  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.67 
 
 		 460 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 552 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  34.18 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  29.73 
 
 		 912 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 124 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0590  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.07 
 
 		 440 aa  52  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  23.93 
 
 		 224 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  31.71 
 
 		 934 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 225 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2092  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 462 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 513 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 470 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  35.06 
 
 		 227 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 874 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  27.86 
 
 		 927 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  32.43 
 
 		 236 aa  51.2  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0723  transcriptional regulator, response regulator  30.68 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1019  cell cycle transcriptional regulator CtrA  34.57 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.736916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0960  histidine kinase  32.5 
 
 		 258 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2580  putative diguanylate phosphodiesterase  26.87 
 
 		 413 aa  51.2  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.465232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5328  putative two-component response regulatory protein  30.86 
 
 		 133 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.152499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 242 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 924 aa  51.2  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 125 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3273  two component Fis family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 194 aa  50.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  32.05 
 
 		 394 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0532  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  29.2 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.693911  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  32.05 
 
 		 394 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.07 
 
 		 242 aa  50.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0841  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.27 
 
 		 466 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.280137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3521  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.25 
 
 		 440 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 628 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4505  transcriptional regulatory protein ZraR  26.87 
 
 		 441 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.11324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1358  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.107991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  30.51 
 
 		 1137 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1572  response regulator receiver domain-containing protein  32.5 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.734194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3035  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4385  transcriptional regulatory protein ZraR  26.87 
 
 		 441 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  31.71 
 
 		 922 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  33.33 
 
 		 394 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.1 
 
 		 276 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1198  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 375 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3488  two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.487721  normal  0.120653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4507  transcriptional regulatory protein ZraR  26.87 
 
 		 441 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0570238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>