More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0406 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0406  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  253  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0029  response regulator receiver protein  79.37 
 
 		 126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3466  response regulator receiver protein  78.05 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3403  response regulator receiver protein  79.66 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.809384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0854  response regulator receiver protein  75.81 
 
 		 124 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3179  response regulator receiver domain-containing protein  75 
 
 		 120 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.164981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3253  response regulator  73.73 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2959  two component signal transduction response regulator  55.2 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.888929  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1426  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0187  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.283319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0458  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000275929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  44.25 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1423  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1469  response regulator receiver protein  47.41 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1627  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3609  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 122 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2332  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1110  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2829  response regulator receiver protein  41.82 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00294817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 227 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  36.67 
 
 		 241 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  36.67 
 
 		 241 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 235 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 247 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1088  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 		 264 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2795  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  36.22 
 
 		 273 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3201  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  43.9 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 		 458 aa  70.5  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 513 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3178  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.51 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2506  sensory box protein/sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  37.04 
 
 		 564 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.92979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.79 
 
 		 446 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2056  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.43 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.732718  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1971  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.43 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0887215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.56 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0821  response regulator receiver modulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.18 
 
 		 1139 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.187038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1908  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 473 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2334  response regulator receiver protein  35 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 483 aa  67.8  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  33.33 
 
 		 248 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 242 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.6 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 496 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1572  nitrogen assimilation regulator receiver protein  31.75 
 
 		 471 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181589  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  30.89 
 
 		 219 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 219 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 227 aa  67  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  38.75 
 
 		 180 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 242 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.77 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3404  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235439  normal  0.675632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  33.9 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  44.87 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2105  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  33.9 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  35.2 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3647  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 471 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0209004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1994  two component signal transduction response regulator  36.36 
 
 		 477 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.91 
 
 		 480 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  35.54 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2505  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.457878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0516  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 468 aa  65.5  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000971097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  30.58 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0958  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.28 
 
 		 513 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  35.2 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1003  nitrogen regulation protein NR(I)  33.02 
 
 		 481 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1498  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 500 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0639  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 455 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>