More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0375 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  100 
 
 		 394 aa  799    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0450  methionine gamma-lyase  85.09 
 
 		 399 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  63.73 
 
 		 399 aa  514  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  59.74 
 
 		 400 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  59.64 
 
 		 398 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  59.39 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  59.39 
 
 		 398 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  58.63 
 
 		 397 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  60.1 
 
 		 396 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  55.67 
 
 		 401 aa  455  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  55.19 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  54.31 
 
 		 393 aa  433  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  50.92 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  48.82 
 
 		 394 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  49.23 
 
 		 390 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  50.51 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  48.18 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  49.09 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  50.26 
 
 		 397 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  47.66 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  49.23 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  47.4 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  49.87 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  49.23 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  47.92 
 
 		 391 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  48.05 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  51.27 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  48.98 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  50 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  48.98 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  48.98 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  49.09 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  47.14 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  47.4 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  47.4 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  46.88 
 
 		 392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  48.47 
 
 		 397 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  45.83 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  45.6 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  48.05 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  49.22 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2664  cystathionine gamma-synthase  48.28 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.16221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  48.44 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  45.34 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  45.94 
 
 		 407 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.08 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  47.44 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.61 
 
 		 389 aa  342  8e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.66 
 
 		 403 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.86 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.86 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  47.44 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.24 
 
 		 393 aa  339  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  47.44 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  49.11 
 
 		 401 aa  338  7e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  48.57 
 
 		 394 aa  336  3.9999999999999995e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  46.37 
 
 		 378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19570  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  42.64 
 
 		 397 aa  335  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.12 
 
 		 395 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.79 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  50 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.3 
 
 		 394 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.77 
 
 		 396 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0842  cystathionine gamma-synthase  47.16 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.905806  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.9 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.13 
 
 		 392 aa  331  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.17 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  46.25 
 
 		 379 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.87 
 
 		 397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.5 
 
 		 410 aa  325  9e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2670  cystathionine gamma-synthase  46.37 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.43 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1453  O-acetylhomoserine sulfhydrylase  43.16 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0976  O-acetylhomoserine/O-acetylserine sulfhydrylase  41.47 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.913845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  47.12 
 
 		 388 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  48.06 
 
 		 390 aa  322  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.61 
 
 		 383 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.99 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.92 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.75 
 
 		 391 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.65 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  46.35 
 
 		 392 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.7 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.39 
 
 		 404 aa  318  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.15 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  46.34 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.19 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  45.34 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  45.64 
 
 		 386 aa  317  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  46.52 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  44.82 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  46.19 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43 
 
 		 406 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  47.94 
 
 		 394 aa  315  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.43 
 
 		 405 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>