165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0249 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0249  protein of unknown function DUF541  100 
 
 		 232 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0357  hypothetical protein  68.66 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0512  hypothetical protein  63.75 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.889697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0217  hypothetical protein  59.07 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330993  hitchhiker  0.00697303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3577  hypothetical protein  59.2 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2778  hypothetical protein  55.81 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0418246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0370  hypothetical protein  53.39 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2321  hypothetical protein  39.22 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2122  hypothetical protein  37.02 
 
 		 235 aa  131  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.213282  normal  0.537025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2073  hypothetical protein  39.26 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.390893  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1932  hypothetical protein  39.81 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828306  normal  0.011783 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1693  hypothetical protein  38.93 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.629234  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01885  outer membrane protein  38.71 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2902  protein of unknown function DUF541  40.1 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2937  protein of unknown function DUF541  38.12 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1475  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  37.45 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371426  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2677  protein of unknown function DUF541  35.44 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0584  hypothetical protein  39.41 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.443893  hitchhiker  0.00000587785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1430  immunoreactive 28 kDa outer membrane protein  38.86 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1305  hypothetical protein  38.65 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.706284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2216  hypothetical protein  41.06 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402013  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4746  hypothetical protein  39.42 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3534  hypothetical protein  37.06 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1626  protein of unknown function DUF541  30.85 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000406911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0885  protein of unknown function DUF541  35.5 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1035  hypothetical protein  36.27 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.36378  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1059  hypothetical protein  37.13 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2980  hypothetical conserved membrane protein  35.5 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0965  26 kDa periplasmic immunogenic protein  31.36 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.152524  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0468  outer membrane protein  31.17 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.36585  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1293  outer membrane protein  34.13 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.269819 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0407  hypothetical protein  30.74 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5375  hypothetical protein  34.17 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4774  hypothetical protein  32.44 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4860  hypothetical protein  32.44 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5160  hypothetical protein  32.44 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13654  lipoprotein lpqG  33.01 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213913  hitchhiker  0.000302056 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2430  hypothetical protein  35.27 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1094  hypothetical protein  36.54 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2663  hypothetical protein  38.42 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3679  protein of unknown function DUF541  32.23 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1869  hypothetical protein  31.17 
 
 		 247 aa  92.8  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1414  hypothetical protein  32.73 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0537413  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1804  protein of unknown function DUF541  33.17 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1417  protein of unknown function DUF541  33.01 
 
 		 246 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0791  protein of unknown function DUF541  35.41 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00137694  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1883  protein of unknown function DUF541  32.69 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2073  hypothetical protein  31.92 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1013  hypothetical protein  34.95 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.454007  normal  0.130025 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3918  hypothetical protein  32.16 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0683  hypothetical protein  29.91 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3826  hypothetical protein  31.32 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0760  hypothetical protein  31.13 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0544  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2072  protein of unknown function DUF541  33.33 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000026389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3450  hypothetical protein  34.59 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0500  hypothetical protein  34.59 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3626  hypothetical protein  34.59 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0600  hypothetical protein  31.51 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3799  hypothetical protein  31.05 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0518  hypothetical protein  31.05 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0539  hypothetical protein  31.05 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4070  hypothetical protein  34.16 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2967  protein of unknown function DUF541  31.9 
 
 		 250 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13213  hypothetical protein  27.47 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2255  hypothetical protein  32.1 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.838126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1759  protein of unknown function DUF541  29.68 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0793  hypothetical protein  30.85 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0486  hypothetical protein  30.34 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1002  hypothetical protein  30.29 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3445  hypothetical protein  37.43 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_974  hypothetical periplasmic protein  32.93 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.873226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2768  protein of unknown function DUF541  36.98 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.304873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1491  hypothetical protein  28.15 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3335  hypothetical protein  35.15 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.176953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1191  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0947  hypothetical protein  29.91 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.328816  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0035  hypothetical protein  29.65 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1996  protein of unknown function DUF541  29.44 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03557  hypothetical protein  31.14 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4501  hypothetical protein  25.79 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2781  hypothetical protein  28.72 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.018694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3913  hypothetical protein  27.13 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00418625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0856  hypothetical protein  30.36 
 
 		 266 aa  72  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0853  hypothetical protein  30.36 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00190315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3823  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000671557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2545  hypothetical protein  28.78 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.394305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3992  hypothetical protein  27.13 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3839  hypothetical protein  27.13 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000376138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4304  hypothetical protein  27.13 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00534133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0357  protein of unknown function DUF541  31.51 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  hitchhiker  0.00987927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002478  hypothetical protein  32.56 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.655633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0558  hypothetical protein  30.73 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1713  protein of unknown function DUF541  33.82 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1045  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.762277  hitchhiker  0.0000415102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3820  hypothetical protein  29.94 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.855963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4215  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000238833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4192  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0673063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2240  protein of unknown function DUF541  29.29 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3238  hypothetical protein  33.53 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>