More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4472 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4472  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 409 aa  812    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00089056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0823  cystathionine gamma-synthase  85.64 
 
 		 406 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  hitchhiker  0.000000196482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1212  Cystathionine gamma-synthase  43.36 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2537  cystathionine gamma-synthase  48.9 
 
 		 410 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  37.62 
 
 		 393 aa  288  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  44.58 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 		 426 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 		 426 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3196  cystathionine gamma-synthase  45 
 
 		 426 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  42.03 
 
 		 423 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  42.03 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  39.8 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  37.84 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  38.06 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  39.66 
 
 		 405 aa  266  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  38.64 
 
 		 390 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  35.86 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  39.01 
 
 		 392 aa  266  5.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  41.25 
 
 		 418 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  40.83 
 
 		 394 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  37.69 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.67 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  39.15 
 
 		 374 aa  265  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.58 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.3 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  40.75 
 
 		 381 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  40.4 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  40.54 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.38 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  39.36 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.51 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  38.56 
 
 		 376 aa  260  3e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  38.48 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  38.48 
 
 		 377 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  37.87 
 
 		 396 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 393 aa  258  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.8 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  38.9 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  38.29 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  39.07 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  37.97 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  38.65 
 
 		 407 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.64 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.8 
 
 		 403 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4139  methionine gamma-lyase  41.67 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  37.97 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  37.78 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.8 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.49 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.59 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  34.17 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  38.85 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  38.89 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  38.14 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  37.72 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  37.56 
 
 		 376 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.84 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0881  cystathionine gamma-synthase  39.36 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  38.8 
 
 		 397 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.38 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.22 
 
 		 406 aa  256  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  38.89 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  40.05 
 
 		 403 aa  255  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  37.72 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  38.61 
 
 		 397 aa  255  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  44.12 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  38.08 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  39.9 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  35.43 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  39.41 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  37.09 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.49 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.06 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  38.18 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.68 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.05 
 
 		 422 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.68 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  39.14 
 
 		 393 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.16 
 
 		 392 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  40.63 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  37.25 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.84 
 
 		 398 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.03 
 
 		 397 aa  252  7e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  38.65 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  38.16 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  36.41 
 
 		 395 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.41 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  37.03 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  37.88 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.52 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.37 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.25 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.16 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>