More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0268 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0268  ABC transporter related  100 
 
 		 277 aa  558  1e-158  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000875319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  89.53 
 
 		 277 aa  501  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  75.1 
 
 		 280 aa  332  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  59.19 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  59.73 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  59.91 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  60.36 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  59.38 
 
 		 230 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  57.08 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  54.95 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  58.18 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  53.36 
 
 		 252 aa  258  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  55.71 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  55.71 
 
 		 248 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  55.07 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  58.06 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  55.07 
 
 		 224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  55.61 
 
 		 233 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  55.16 
 
 		 227 aa  253  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  56.76 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  54.5 
 
 		 230 aa  252  6e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  54.19 
 
 		 224 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  54.63 
 
 		 224 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  53.42 
 
 		 242 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  54.19 
 
 		 224 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  53.25 
 
 		 249 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  51.48 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  58.06 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  54.19 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  54.19 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  55.45 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  54.19 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  56.31 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  55.45 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  54.95 
 
 		 232 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  54.19 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  52.32 
 
 		 254 aa  249  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  52.02 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  53.36 
 
 		 240 aa  249  4e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  54.3 
 
 		 236 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  56.48 
 
 		 225 aa  248  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  54.46 
 
 		 233 aa  248  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  53.74 
 
 		 224 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  58.56 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.53 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  57.08 
 
 		 229 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  59.47 
 
 		 238 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  58.22 
 
 		 221 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  53.15 
 
 		 225 aa  246  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  58.11 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  52.44 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  58.37 
 
 		 241 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  54.34 
 
 		 225 aa  245  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  55.31 
 
 		 228 aa  244  9e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  56.11 
 
 		 228 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  53.6 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  55.66 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  56.83 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  53.18 
 
 		 236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  53.88 
 
 		 238 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  55.11 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  54.55 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  52.05 
 
 		 226 aa  242  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  50.2 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  49.57 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  52.51 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  52.97 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  52.89 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 226 aa  239  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  59.73 
 
 		 242 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  55.2 
 
 		 224 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  53.15 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0318  ABC transporter related  52.7 
 
 		 229 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  57.01 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 		 232 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  53.15 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.12 
 
 		 235 aa  237  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  53.39 
 
 		 233 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  53.15 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  49.12 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  53.15 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  51.56 
 
 		 235 aa  236  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  52.05 
 
 		 228 aa  236  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  54.55 
 
 		 241 aa  235  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  52.7 
 
 		 246 aa  235  6e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  51.8 
 
 		 226 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  56.64 
 
 		 241 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  52.7 
 
 		 226 aa  235  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  55.91 
 
 		 233 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>