106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0052 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0052  peptidase M23B  100 
 
 		 382 aa  763    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.672744  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4194  peptidase M23B  81.11 
 
 		 382 aa  598  1e-170  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2877  Peptidase M23  51.08 
 
 		 381 aa  339  4e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2907  peptidase M23B  38.61 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.419001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  30.53 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  31.65 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1852  peptidase M23B  32.76 
 
 		 487 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  41.35 
 
 		 503 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  32.46 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1423  Peptidase M23  39.73 
 
 		 461 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  43.24 
 
 		 288 aa  50.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5760  peptidase M23B  33.04 
 
 		 443 aa  49.7  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  33.65 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  40.45 
 
 		 320 aa  49.7  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  36.89 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  26.15 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  30.08 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  34.21 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  30 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  30.25 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  26.51 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  31.21 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  38.3 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  31.75 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  31.96 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.33 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.33 
 
 		 475 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  40.79 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  34.81 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  26.51 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  32.53 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  41.33 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  36 
 
 		 480 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  29.55 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  25.9 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  29.55 
 
 		 473 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  38.3 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  27.34 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.25 
 
 		 309 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  39.36 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.48 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  39.24 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  34.51 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  29.55 
 
 		 473 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  36.84 
 
 		 453 aa  46.6  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  27.27 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  40 
 
 		 465 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  35.48 
 
 		 417 aa  46.2  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  39.36 
 
 		 294 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1761  Peptidase M23  36.47 
 
 		 198 aa  46.2  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.0405992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.21 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  31.3 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.21 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  34.31 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  36.19 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  29.84 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.33 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.36 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.87 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  31.47 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.84 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  31.25 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  34.21 
 
 		 273 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.79 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.03 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  34.62 
 
 		 216 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  28.95 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  35.53 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  36.36 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  36.54 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  40.79 
 
 		 741 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  28.7 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  33.65 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  28.57 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.54 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.54 
 
 		 321 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  36.17 
 
 		 577 aa  43.9  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  38.82 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  34.62 
 
 		 272 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  37.65 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  29.17 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.11 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  27.27 
 
 		 273 aa  43.5  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  36.99 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  33.72 
 
 		 449 aa  43.5  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  39.19 
 
 		 238 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1796  twin-arginine translocation pathway signal  37.18 
 
 		 244 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  31.67 
 
 		 669 aa  43.5  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  34.21 
 
 		 541 aa  43.5  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  37.65 
 
 		 425 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.25 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  35.11 
 
 		 581 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  35.42 
 
 		 538 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  34.62 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  34 
 
 		 599 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.71 
 
 		 287 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  27.27 
 
 		 244 aa  42.7  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  35.11 
 
 		 357 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.869131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>