105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4194 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4194  peptidase M23B  100 
 
 		 382 aa  766    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0052  peptidase M23B  79.89 
 
 		 382 aa  595  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.672744  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2877  Peptidase M23  50.67 
 
 		 381 aa  338  8e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2907  peptidase M23B  39.77 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.419001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1381  peptidase M23B  30.53 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.897006  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3026  Peptidase M23  32.12 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  39.42 
 
 		 503 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2500  peptidase M23B  32.37 
 
 		 506 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1423  Peptidase M23  41.1 
 
 		 461 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  30.83 
 
 		 475 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  30.83 
 
 		 473 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  38.67 
 
 		 474 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  38.67 
 
 		 475 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.11 
 
 		 503 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.83 
 
 		 473 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  37.33 
 
 		 480 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1689  peptidase M23B  26.72 
 
 		 261 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  42.67 
 
 		 468 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1852  peptidase M23B  31.62 
 
 		 487 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  34.67 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  33.98 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  30.4 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  37.27 
 
 		 328 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  38.67 
 
 		 472 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  32.74 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  38.3 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0898  peptidase M23B  33.33 
 
 		 264 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.206308 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  30.93 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  35 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  37.97 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  39.53 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  31.19 
 
 		 465 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  38.54 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  28.21 
 
 		 735 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.54 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  38.2 
 
 		 320 aa  46.6  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  34.69 
 
 		 389 aa  46.2  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  39.36 
 
 		 294 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  35.87 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  34.21 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  34.53 
 
 		 425 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  36.84 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5760  peptidase M23B  32.74 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  34.53 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.17 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.89 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  25.97 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.21 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  30.09 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  30.83 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  31.58 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  32.17 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.21 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  35.29 
 
 		 592 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  24.03 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  34.53 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  30.59 
 
 		 999 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  36.14 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  31.63 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03923  peptidase M23B  27.05 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0458107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.79 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1475  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.38 
 
 		 309 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  33.57 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.96 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  29.61 
 
 		 478 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  30.16 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  34.67 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  31.4 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.33 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.11 
 
 		 404 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  36.49 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1796  twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 		 244 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  30.17 
 
 		 253 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  33.33 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  30.59 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  33.33 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  30.91 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  30.93 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  33.09 
 
 		 466 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  32.76 
 
 		 615 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  26.45 
 
 		 325 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  31.67 
 
 		 271 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.78 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1761  Peptidase M23  35.05 
 
 		 198 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.0405992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  33.57 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  28.21 
 
 		 995 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  33.57 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  36 
 
 		 475 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  33.57 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  35.78 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  34.38 
 
 		 538 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  33.04 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  32.17 
 
 		 527 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  41.03 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  35.78 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  32.8 
 
 		 272 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.16 
 
 		 741 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  25.18 
 
 		 269 aa  43.5  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  28.91 
 
 		 277 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>