More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0041 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  100 
 
 
594 aa  1181    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  38.38 
 
 
576 aa  379  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  40.61 
 
 
579 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  37.39 
 
 
592 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  41.32 
 
 
1179 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  41.32 
 
 
1179 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.8 
 
 
1179 aa  347  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.21 
 
 
1201 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  40.24 
 
 
1179 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  35.58 
 
 
585 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.74 
 
 
562 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 
562 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  31.14 
 
 
552 aa  333  5e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.56 
 
 
573 aa  326  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.98 
 
 
552 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  36.02 
 
 
609 aa  322  8e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.92 
 
 
575 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  34.75 
 
 
574 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  31.74 
 
 
566 aa  318  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.58 
 
 
573 aa  316  7e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0697  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.69 
 
 
574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1666  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.51 
 
 
576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000461828  normal  0.671696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.21 
 
 
573 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  34.65 
 
 
583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.94 
 
 
579 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.74 
 
 
582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.46 
 
 
584 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.28 
 
 
582 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0472  ATPase  36.39 
 
 
578 aa  298  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.28 
 
 
571 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.57 
 
 
588 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1110  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.85 
 
 
585 aa  294  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  33.33 
 
 
1205 aa  294  4e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1390  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.85 
 
 
585 aa  294  4e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4595  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  35.22 
 
 
547 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  36.25 
 
 
595 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  37.04 
 
 
580 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.82 
 
 
993 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1293  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.55 
 
 
562 aa  289  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.408226  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  29.35 
 
 
578 aa  287  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  29.35 
 
 
578 aa  287  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.03 
 
 
608 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.03 
 
 
556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.71 
 
 
582 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0194  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  35.71 
 
 
567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.505034  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  37.1 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.77 
 
 
582 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.18 
 
 
597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  34.73 
 
 
616 aa  283  7.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2747  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  36.35 
 
 
579 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246338  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.6 
 
 
555 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.67 
 
 
597 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.24 
 
 
591 aa  282  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.22 
 
 
586 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  32.88 
 
 
589 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  30.57 
 
 
580 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.61 
 
 
583 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  32.33 
 
 
572 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  32.33 
 
 
572 aa  280  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2199  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.05 
 
 
600 aa  280  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.83 
 
 
581 aa  279  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.39 
 
 
579 aa  279  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  31.74 
 
 
579 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  33.11 
 
 
571 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.61 
 
 
596 aa  278  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  34.13 
 
 
578 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.7 
 
 
582 aa  277  5e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.21 
 
 
585 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  33.9 
 
 
594 aa  276  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  34.99 
 
 
584 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.5 
 
 
582 aa  276  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.62 
 
 
582 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.62 
 
 
582 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.62 
 
 
582 aa  276  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.48 
 
 
613 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00890  fused cysteine transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.5 
 
 
573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.140695  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00897  hypothetical protein  32.5 
 
 
573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.17678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.14 
 
 
572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  35.56 
 
 
625 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.5 
 
 
573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00743956  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  32.94 
 
 
601 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.39 
 
 
577 aa  274  3e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  32.87 
 
 
601 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.39 
 
 
597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.29 
 
 
600 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.32 
 
 
573 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.83 
 
 
578 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.39 
 
 
572 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 
626 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  30.94 
 
 
566 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  34.63 
 
 
613 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.16 
 
 
602 aa  273  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  34.79 
 
 
593 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.92 
 
 
575 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  30.8 
 
 
597 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.14 
 
 
573 aa  273  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1048  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  32.5 
 
 
573 aa  273  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00703817  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.6 
 
 
577 aa  273  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  30.59 
 
 
615 aa  272  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>