268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4808 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  100 
 
 		 455 aa  939    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4206  Di-haem cytochrome c peroxidase  66.82 
 
 		 463 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4316  Di-heme cytochrome c peroxidase  66.82 
 
 		 463 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65624 
 
 
-
 
NC_003296  RS05063  lipoprotein transmembrane  67.38 
 
 		 441 aa  594  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal  0.0603302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2833  Di-haem cytochrome c peroxidase  54.4 
 
 		 460 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.85653  decreased coverage  0.00293873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1302  putative di-haem cytochrome c peroxidase  60.53 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1279  di-haem cytochrome c peroxidase  52.99 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1913  di-haem cytochrome c peroxidase  60.43 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.452525 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1628  di-haem cytochrome c peroxidase  60.05 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.171293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0887  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  60.55 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1805  di-haem cytochrome c peroxidase  60.05 
 
 		 467 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4546  di-haem cytochrome c peroxidase  52.69 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0694  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  60.05 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1649  di-haem cytochrome c peroxidase  60.33 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353955  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0465  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  60.05 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00419693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1412  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  60.05 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.779688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1380  di-haem cytochrome c peroxidase  58.18 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0920  di-haem cytochrome c peroxidase  57.22 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1402  di-haem cytochrome c peroxidase  57.22 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1313  di-haem cytochrome c peroxidase  57.56 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0706759 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2670  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  56.38 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1696  Di-heme cytochrome c peroxidase  51.63 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5888  Di-haem cytochrome c peroxidase  52.62 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1613  di-haem cytochrome c peroxidase  50.53 
 
 		 424 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0610  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.1 
 
 		 536 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.673254  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1042  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.34 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.023459  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1637  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.9 
 
 		 525 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1823  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.1 
 
 		 536 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0857  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  48.1 
 
 		 536 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6009  di-haem cytochrome c peroxidase  47.74 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2342  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  47.65 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349952  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4022  di-haem cytochrome c peroxidase  47.74 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4228  di-haem cytochrome c peroxidase  47.64 
 
 		 449 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4344  di-haem cytochrome c peroxidase  47.74 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4631  di-haem cytochrome c peroxidase  49.01 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1675  di-haem cytochrome c peroxidase  46.7 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3754  di-haem cytochrome c peroxidase  46.3 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4273  di-haem cytochrome c peroxidase  46.24 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3756  di-haem cytochrome c peroxidase  45.75 
 
 		 480 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5017  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.09 
 
 		 480 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.130881  normal  0.0650022 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0723  Di-heme cytochrome c peroxidase  45.02 
 
 		 451 aa  325  9e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0259217  normal  0.788287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3582  Di-heme cytochrome c peroxidase  44.05 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0770126  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3802  hypothetical protein  41.73 
 
 		 454 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0346  putative cytochrome c peroxidase  39.31 
 
 		 491 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01731  lipoprotein  40.82 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1889  Di-haem cytochrome c peroxidase  39.04 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0196458  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2493  signal peptide protein  39.73 
 
 		 449 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1560  Di-heme cytochrome c peroxidase  38.54 
 
 		 413 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  0.27225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5305  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.82 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16606  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0945  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2756  putative signal peptide protein  40.43 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.852122  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1394  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.136997  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0435  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0210  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.48 
 
 		 540 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1890  di-haem cytochrome c peroxidase  40.21 
 
 		 540 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0353  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  40.21 
 
 		 540 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1805  di-haem cytochrome c peroxidase  40.21 
 
 		 540 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2353  Di-heme cytochrome c peroxidase  40.27 
 
 		 446 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.332837  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4041  di-haem cytochrome c peroxidase  37.78 
 
 		 448 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.352643 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1092  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.54 
 
 		 543 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4434  di-haem cytochrome c peroxidase  38.68 
 
 		 458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4214  di-haem cytochrome c peroxidase  37.87 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4152  di-haem cytochrome c peroxidase  37.87 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333964  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0550  di-haem cytochrome c peroxidase  38.12 
 
 		 456 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.77127  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3364  di-haem cytochrome c peroxidase  37.97 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1948  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  38.12 
 
 		 474 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0165417  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1878  di-haem cytochrome c peroxidase  37.78 
 
 		 465 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3560  di-haem cytochrome c peroxidase  37.53 
 
 		 448 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1906  cytochrome c peroxidase family protein  37.3 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3302  di-haem cytochrome c peroxidase  37.2 
 
 		 353 aa  186  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2302  Cytochrome-c peroxidase  33.98 
 
 		 361 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1769  cytochrome c peroxidase family protein  33.66 
 
 		 422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.391273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1422  di-haem cytochrome c peroxidase  32.97 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0511364  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1538  methylamine utilization protein MauG, putative  31.87 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258234  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0920  di-haem cytochrome c peroxidase family protein  43.26 
 
 		 196 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4736  di-haem cytochrome c peroxidase  36.24 
 
 		 387 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0936086  normal  0.189061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2351  di-haem cytochrome c peroxidase  30.54 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118544  normal  0.0769716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1210  methylamine utilization protein MauG, putative  28.57 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000191755  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  30.03 
 
 		 768 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2760  cytochrome c peroxidase family protein  29.32 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1600  Cytochrome-c peroxidase  29.2 
 
 		 357 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.282012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2766  cytochrome-c peroxidase  28.61 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.783041  normal  0.878036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2378  cytochrome-c peroxidase  30.05 
 
 		 346 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0541294  normal  0.454259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0386  Cytochrome-c peroxidase  27.25 
 
 		 431 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.258024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0766  cytochrome-c peroxidase  29.69 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0350  Cytochrome-c peroxidase  27.3 
 
 		 311 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1316  cytochrome-c peroxidase  30.95 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000633381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1353  cytochrome-c peroxidase  28.16 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5340  Cytochrome-c peroxidase  26.9 
 
 		 377 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0026  Cytochrome-c peroxidase  28.8 
 
 		 521 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3388  Cytochrome-c peroxidase  29.46 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0777  Cytochrome-c peroxidase  28.12 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000325432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2381  Cytochrome-c peroxidase  28.39 
 
 		 616 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.298438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4046  Cytochrome-c peroxidase  27.66 
 
 		 360 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.399285  normal  0.0466935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0559  Cytochrome-c peroxidase  29.71 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0178  cytochrome c551 peroxidase  31.03 
 
 		 344 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1107  cytochrome-c peroxidase  28.62 
 
 		 417 aa  96.7  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.63501  normal  0.861161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2813  cytochrome c551 peroxidase  30.57 
 
 		 345 aa  96.7  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259536  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3340  cytochrome-c peroxidase  27.15 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2005  putative cytochrome c peroxidase  27.9 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>