More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2926 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0959  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  70.11 
 
 		 501 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.967814  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2666  glycolate oxidase FAD-linked subunit oxidoreductase  85.4 
 
 		 497 aa  874    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0702  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.8 
 
 		 497 aa  772    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138361 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2414  glycolate oxidase, subunit GlcD  74.8 
 
 		 497 aa  760    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0331  glycolate oxidase, subunit GlcD  74.8 
 
 		 497 aa  760    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3315  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  70.33 
 
 		 496 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.422643  hitchhiker  0.00320306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0645  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.53 
 
 		 511 aa  703    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2790  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  89.33 
 
 		 506 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3296  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  74.8 
 
 		 497 aa  762    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0720  FAD linked oxidase domain protein  76 
 
 		 497 aa  788    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.732845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  73.08 
 
 		 511 aa  692    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3342  glycolate oxidase, subunit GlcD  74.8 
 
 		 497 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0417  FAD linked oxidase domain protein  74.12 
 
 		 500 aa  702    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.589159  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3820  FAD linked oxidase-like  74.2 
 
 		 497 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0635309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2902  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  87.55 
 
 		 497 aa  874    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.495619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3260  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.8 
 
 		 512 aa  709    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0425  FAD linked oxidase domain-containing protein  73.91 
 
 		 494 aa  703    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2652  FAD linked oxidase domain-containing protein  73.4 
 
 		 497 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0510945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  65.76 
 
 		 485 aa  648    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  76.45 
 
 		 501 aa  799    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0650  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.95 
 
 		 497 aa  768    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1291  glycolate oxidase, subunit GlcD  74.8 
 
 		 497 aa  759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2496  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  85.6 
 
 		 499 aa  877    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  63.07 
 
 		 503 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0606  FAD linked oxidase-like  71.14 
 
 		 492 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0433  FAD linked oxidase-like  71.86 
 
 		 500 aa  687    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0293  FAD linked oxidase domain-containing protein  70.8 
 
 		 500 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  75.8 
 
 		 497 aa  785    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1083  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.95 
 
 		 517 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  100 
 
 		 500 aa  1020    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1781  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  75.52 
 
 		 501 aa  752    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1637  FAD linked oxidase domain protein  72.21 
 
 		 503 aa  710    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0250  FAD linked oxidase-like  74.6 
 
 		 497 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  62.4 
 
 		 499 aa  634    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2601  glycolate oxidase, subunit GlcD  74.8 
 
 		 497 aa  760    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0222  FAD linked oxidase domain protein  72.31 
 
 		 502 aa  704    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0624  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.95 
 
 		 497 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.864789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3330  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  74.8 
 
 		 497 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.510979  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0734  FAD linked oxidase domain-containing protein  74.6 
 
 		 497 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1192  glycolate oxidase, subunit GlcD  74.6 
 
 		 497 aa  758    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3638  putative glycolate oxidase (FAD-linked subunit) oxidoreductase protein  73.77 
 
 		 504 aa  737    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147047  normal  0.472178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1170  FAD linked oxidase domain-containing protein  71.64 
 
 		 529 aa  679    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  62.4 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2687  glycolate oxidase subunit GlcD  64.32 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  62.6 
 
 		 499 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  62.4 
 
 		 499 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  62 
 
 		 499 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  61.8 
 
 		 499 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  62.24 
 
 		 499 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  60.65 
 
 		 499 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  62.03 
 
 		 499 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  60.04 
 
 		 499 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  60.04 
 
 		 499 aa  615  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  62.68 
 
 		 499 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  60.89 
 
 		 499 aa  616  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  61.8 
 
 		 499 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  60.04 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  60.04 
 
 		 496 aa  615  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  59.84 
 
 		 499 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  63.48 
 
 		 498 aa  612  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  59.84 
 
 		 496 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  61.41 
 
 		 499 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  62.55 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  60.6 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  59.84 
 
 		 499 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  63.62 
 
 		 499 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1894  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.76 
 
 		 500 aa  608  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  64.16 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.17 
 
 		 496 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  62.27 
 
 		 499 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  61.41 
 
 		 484 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  61.87 
 
 		 499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0047  glycolate oxidase, subunit GlcD  63.33 
 
 		 483 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.424124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0203  glycolate oxidase subunit GlcD  60.45 
 
 		 499 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.60934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  62.2 
 
 		 490 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  57.66 
 
 		 492 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  57.17 
 
 		 497 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  58.18 
 
 		 497 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.45 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  59.74 
 
 		 488 aa  559  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  57.99 
 
 		 497 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  59.53 
 
 		 488 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.35 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  56.56 
 
 		 495 aa  542  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  56.11 
 
 		 497 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  56.94 
 
 		 497 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.31 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  56.73 
 
 		 497 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  55.07 
 
 		 498 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  54.87 
 
 		 498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.41 
 
 		 498 aa  513  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  55.37 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  54.04 
 
 		 498 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  55.17 
 
 		 497 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.77 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  49.24 
 
 		 477 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.11 
 
 		 479 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.68 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  48.04 
 
 		 497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  50.54 
 
 		 477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>