63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1940 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  58.2 
 
 		 248 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  56.14 
 
 		 251 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  51.78 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  52.17 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  51 
 
 		 255 aa  214  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  54.98 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  53.68 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  53.68 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  53.25 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3914  hypothetical protein  39.6 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  38.28 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5609  protein of unknown function DUF81  36.82 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  33.02 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  31.53 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  31.53 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  27.03 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  28.94 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  30.71 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  27.09 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.26 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  28.99 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  31.88 
 
 		 250 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  28.64 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4346  hypothetical protein  26.09 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  24.89 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  26.38 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  24.31 
 
 		 220 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  30.52 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  27.95 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  27.95 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.88 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  38.04 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  26.23 
 
 		 343 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  37.78 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  27.88 
 
 		 251 aa  46.2  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25.22 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  24.9 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  22.27 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  26.16 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.49 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.49 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  26.41 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  26.61 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  29.08 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  27.56 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  28.71 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  24.3 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  29.33 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  29.36 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  30.89 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  27.49 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  27.27 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  30.87 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  24.83 
 
 		 255 aa  42.7  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  27.73 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  24.53 
 
 		 346 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.87 
 
 		 245 aa  42.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  31.02 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>