124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0926 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0926  protein of unknown function DUF87  100 
 
 		 553 aa  1132    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3183  hypothetical protein  54.23 
 
 		 538 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837382  normal  0.234519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1701  hypothetical protein  53.04 
 
 		 539 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.016697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1906  hypothetical protein  48.65 
 
 		 579 aa  508  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000004225  normal  0.0184215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  50.19 
 
 		 542 aa  510  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0132  protein of unknown function DUF87  53.04 
 
 		 534 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0970919  decreased coverage  0.000025846 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4844  hypothetical protein  45.98 
 
 		 579 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1585  protein of unknown function DUF87  48.16 
 
 		 572 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.049395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0453  protein of unknown function DUF87  48.45 
 
 		 568 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3692  protein of unknown function DUF87  46.62 
 
 		 569 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1479  hypothetical protein  46.91 
 
 		 580 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0102316  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2419  protein of unknown function DUF87  46.62 
 
 		 569 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  44.11 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  43.55 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0306  hypothetical protein  44.11 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1140  protein of unknown function DUF87  40 
 
 		 554 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1619  hypothetical protein  25 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  25 
 
 		 540 aa  99  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  28.15 
 
 		 628 aa  95.5  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  25.27 
 
 		 546 aa  92  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  25.06 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  24.83 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  23.72 
 
 		 611 aa  76.6  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0751  protein of unknown function DUF87  22.44 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14388  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.06 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  24.77 
 
 		 616 aa  73.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  24.93 
 
 		 559 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  22.72 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  25.63 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  25.24 
 
 		 495 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  24.87 
 
 		 608 aa  73.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  23.46 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.11 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  22.22 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  34.86 
 
 		 709 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  22.47 
 
 		 497 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1440  hypothetical protein  24.26 
 
 		 539 aa  69.3  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  25.2 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.79 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.39 
 
 		 500 aa  67  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 623 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  23.37 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  25.41 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  36.59 
 
 		 599 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  21.98 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  22.89 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  30.73 
 
 		 670 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  37.17 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  25.36 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.58 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  30.05 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  34.38 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  23.06 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  25.06 
 
 		 569 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  33.82 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  23.36 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  23.8 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  25.57 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  32.46 
 
 		 570 aa  60.5  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  28.43 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  31.25 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  30.34 
 
 		 594 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  34.17 
 
 		 574 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  33.91 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  31.5 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  35 
 
 		 579 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  25.86 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  32.77 
 
 		 600 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  35.71 
 
 		 524 aa  55.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  33.33 
 
 		 709 aa  56.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  34.88 
 
 		 526 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  30.95 
 
 		 714 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  28.8 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  35.71 
 
 		 591 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  22.74 
 
 		 612 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2387  protein of unknown function DUF87  23.18 
 
 		 708 aa  54.3  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.10181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  37.23 
 
 		 587 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1882  protein of unknown function DUF87  22.52 
 
 		 581 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000610913 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  25.05 
 
 		 523 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  28.85 
 
 		 679 aa  52.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  24.5 
 
 		 540 aa  51.6  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2256  hypothetical protein  26.4 
 
 		 651 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  36.51 
 
 		 550 aa  52  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  27.93 
 
 		 693 aa  51.6  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  33.93 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  24.59 
 
 		 674 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  35.9 
 
 		 557 aa  51.6  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  24.37 
 
 		 524 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  33.93 
 
 		 583 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  30.4 
 
 		 577 aa  50.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  33.04 
 
 		 617 aa  50.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  33.93 
 
 		 628 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  26.13 
 
 		 679 aa  50.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  38.1 
 
 		 579 aa  50.4  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  33.04 
 
 		 584 aa  50.4  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0321  hypothetical protein  26.65 
 
 		 499 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2149  ATPase  34.62 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  26.45 
 
 		 662 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  29.66 
 
 		 664 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>