More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4804 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4804  histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  896    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631947  normal  0.828013 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0203  two component sensor kinase  45.8 
 
 		 451 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1886  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 459 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6193  histidine kinase  35.27 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 448 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5572  putative two-component sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 471 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.118515 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4693  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 458 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3512  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4403  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 454 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 447 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0300234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4931  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 450 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.231481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 		 458 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  31.34 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  28.6 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3188  histidine kinase  33.26 
 
 		 456 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10722  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3157  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0710965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 460 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  28.6 
 
 		 458 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  33.09 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 463 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  33.09 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 459 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.741916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0175865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  29.19 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0895  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 461 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 439 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  28.61 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 445 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.0265162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  29.2 
 
 		 471 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  30.55 
 
 		 464 aa  159  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  29.2 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1067  histidine kinase  29 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4325  hypothetical protein  31.92 
 
 		 411 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.36321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.123629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 471 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2544  putative two-component sensor  30.99 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0961662  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29740  putative two-component sensor  31.24 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 460 aa  150  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.378674  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1948  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 439 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.014264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4047  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.596315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  26.3 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0802  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 463 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00906644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 475 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131083  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.4 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1359  two component sensor kinase  27.66 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1996  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.540244  normal  0.136551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3512  histidine kinase  30.44 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00937623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 441 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  36.47 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  26.85 
 
 		 432 aa  143  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 481 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  26.33 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3693  histidine kinase  29.55 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.213045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139912  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 441 aa  141  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000460347  hitchhiker  0.000037431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5100  histidine kinase  30.06 
 
 		 482 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368053  normal  0.11003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0614  ATPase domain-containing protein  29.55 
 
 		 442 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.617782  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 442 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000150109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  28.98 
 
 		 456 aa  140  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0429  sensor histidine kinase FeuQ  26.26 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3750  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.98279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.684402  normal  0.489398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0615  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.27687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3211  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.608335  normal  0.379725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3415  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 442 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147478  normal  0.210462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3876  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000107272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1355  Signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 490 aa  136  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.713299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1389  sensor protein PhoQ  27.98 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0621  sensor histidine kinase  29.42 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0848259  normal  0.136137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  30.1 
 
 		 517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  27.9 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3380  sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.625161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4170  histidine kinase  29.77 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3778  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  30.98 
 
 		 483 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>