60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3844 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  79.8 
 
 		 198 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  73.47 
 
 		 196 aa  296  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  74.47 
 
 		 196 aa  285  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  71.35 
 
 		 196 aa  278  5e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  71.35 
 
 		 222 aa  277  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  69.68 
 
 		 195 aa  270  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  47.49 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  48.68 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  47.89 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  44.85 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  44.85 
 
 		 193 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  44.33 
 
 		 193 aa  151  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  46.32 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  46.29 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  46.11 
 
 		 198 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  45.79 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  44.74 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  44.74 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  44.79 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  43.75 
 
 		 192 aa  141  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  40.11 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  40.57 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  44.51 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  43.75 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  42.02 
 
 		 193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  41.38 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  39.49 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  40.72 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  42.05 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  40.23 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  38.71 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  37.43 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  34.03 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  36.36 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  34.64 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  35.16 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  35.26 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  34.88 
 
 		 214 aa  98.2  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  31.76 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  32 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  30.37 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.94 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  36.47 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  34.3 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  30.89 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  31.75 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  33.71 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  32.75 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  34.5 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  31.14 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  26.54 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  24.84 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.64 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  26.28 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  27.46 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  28.97 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  27.98 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  29.41 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>