142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2792 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2792  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
679 aa  1383    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.744858  normal  0.636348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2804  hypothetical protein  66.47 
 
 
693 aa  878    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2009  hypothetical protein  76.23 
 
 
662 aa  873    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184515  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2533  protein of unknown function DUF87  93.81 
 
 
674 aa  1265    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1486  hypothetical protein  54.06 
 
 
560 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1803  hypothetical protein  51.88 
 
 
626 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  46.53 
 
 
583 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  44.63 
 
 
583 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  44.44 
 
 
582 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1248  hypothetical protein  42.99 
 
 
617 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.531682  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  44.07 
 
 
628 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  42.81 
 
 
584 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3526  hypothetical protein  45.07 
 
 
583 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543626  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5753  hypothetical protein  44.88 
 
 
612 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.985257  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5744  hypothetical protein  47.47 
 
 
590 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1359  hypothetical protein  39.03 
 
 
570 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.997931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3545  hypothetical protein  37.84 
 
 
544 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.652004  normal  0.57462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0605  hypothetical protein  38.13 
 
 
569 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.035358  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2640  hypothetical protein  36.49 
 
 
569 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1238  protein of unknown function DUF87  32.78 
 
 
575 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  30.96 
 
 
607 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  27.46 
 
 
546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  27.42 
 
 
593 aa  193  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  28.1 
 
 
550 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0310  protein of unknown function DUF87  27.52 
 
 
679 aa  187  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.724586  normal  0.179177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  28.29 
 
 
594 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  25.66 
 
 
599 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1674  protein of unknown function DUF87  25.94 
 
 
591 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.1078  normal  0.193887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0961  protein of unknown function DUF87  27.08 
 
 
595 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000841984  hitchhiker  0.00444389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0098  hypothetical protein  26.62 
 
 
623 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  29.13 
 
 
587 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0239  hypothetical protein  27.58 
 
 
579 aa  159  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.290251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  27.1 
 
 
591 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0451  protein of unknown function DUF87  28.48 
 
 
526 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  27.1 
 
 
559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0482  protein of unknown function DUF87  27.69 
 
 
577 aa  144  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  29.84 
 
 
579 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  38.34 
 
 
709 aa  126  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3200  ATPase-like protein  25.09 
 
 
659 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4576  ATPase-like protein  29.77 
 
 
664 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26835  normal  0.0312719 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0709  protein of unknown function DUF87  27.31 
 
 
714 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1044  ATPase-like protein  29.87 
 
 
674 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.81 
 
 
709 aa  100  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  35.47 
 
 
603 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0203  protein of unknown function DUF87  35.88 
 
 
670 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.187802 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  26.84 
 
 
520 aa  97.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  26.3 
 
 
557 aa  94.4  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  36.48 
 
 
601 aa  94.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  31.31 
 
 
617 aa  92.8  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  24.95 
 
 
600 aa  91.7  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.46 
 
 
497 aa  91.3  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0760  hypothetical protein  25.27 
 
 
492 aa  90.5  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.360251  normal  0.0367515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4980  hypothetical protein  24.05 
 
 
570 aa  87.8  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  24.03 
 
 
531 aa  87.4  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3925  protein of unknown function DUF87  34.39 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  25.06 
 
 
500 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  31.72 
 
 
560 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  31.06 
 
 
611 aa  83.2  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  31.85 
 
 
605 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4332  hypothetical protein  23 
 
 
427 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0981  hypothetical protein  29.52 
 
 
564 aa  82  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0983657  normal  0.0399667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  25.14 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  32.03 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  24.68 
 
 
524 aa  80.9  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5297  protein of unknown function DUF87  36.61 
 
 
563 aa  80.5  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  31.25 
 
 
616 aa  80.5  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  30 
 
 
608 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  24.61 
 
 
496 aa  78.6  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  33.33 
 
 
574 aa  77.4  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  33.33 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  31.5 
 
 
559 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  33.33 
 
 
497 aa  77  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5073  ATPase-like  22.76 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  32.2 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1515  protein of unknown function DUF87  24.94 
 
 
530 aa  74.3  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.649754  normal  0.132485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  31.5 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  32.69 
 
 
557 aa  73.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1610  hypothetical protein  36.07 
 
 
628 aa  72.8  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.891235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0074  hypothetical protein  35.25 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0871233  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  32.23 
 
 
589 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0349  protein of unknown function DUF87  22.07 
 
 
540 aa  68.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1138  hypothetical protein  35.09 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  30.61 
 
 
524 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  22.76 
 
 
546 aa  65.1  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2366  protein of unknown function DUF87  30.16 
 
 
592 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.250268  normal  0.14702 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3279  hypothetical protein  19.27 
 
 
590 aa  64.3  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1865  hypothetical protein  29.31 
 
 
655 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0131162 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  33.03 
 
 
523 aa  63.5  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  33.33 
 
 
523 aa  62.8  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2954  hypothetical protein  23.88 
 
 
589 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000103337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  37.7 
 
 
360 aa  62.4  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0937  hypothetical protein  33.05 
 
 
540 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0147133  normal  0.254287 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  27.89 
 
 
524 aa  62  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2549  hypothetical protein  27.97 
 
 
542 aa  60.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0753  protein of unknown function DUF87  32.54 
 
 
506 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0799035  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1183  hypothetical protein  24.4 
 
 
811 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5115  hypothetical protein  26.88 
 
 
595 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0326  hypothetical protein  30 
 
 
530 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0355  ATPase-like protein  25.81 
 
 
250 aa  58.9  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_268  hypothetical protein  30 
 
 
530 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>