47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0411 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  93.49 
 
 		 630 aa  1163    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  100 
 
 		 630 aa  1254    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  38.16 
 
 		 651 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  33.1 
 
 		 608 aa  312  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  28.68 
 
 		 649 aa  233  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  28.75 
 
 		 645 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  28.59 
 
 		 645 aa  223  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  26.69 
 
 		 603 aa  198  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  25.97 
 
 		 626 aa  153  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  25.7 
 
 		 654 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  23.57 
 
 		 648 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  24.1 
 
 		 655 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  21.13 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.72 
 
 		 643 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.7 
 
 		 656 aa  104  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  22.03 
 
 		 649 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  23.5 
 
 		 654 aa  96.3  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  22.08 
 
 		 655 aa  91.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.74 
 
 		 677 aa  90.9  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  24.39 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  21.8 
 
 		 642 aa  85.1  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.43 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  23.17 
 
 		 610 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  21.75 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  25 
 
 		 1273 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  27.01 
 
 		 649 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  27.93 
 
 		 1331 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1230 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  24.07 
 
 		 649 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  22.63 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  23.34 
 
 		 602 aa  50.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  25.9 
 
 		 656 aa  50.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1238 aa  50.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1234 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  23.5 
 
 		 655 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  22.8 
 
 		 632 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1141 aa  48.1  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  20.06 
 
 		 640 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  24.2 
 
 		 705 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.2 
 
 		 646 aa  47.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  21.58 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  20.47 
 
 		 1278 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  20.17 
 
 		 1077 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1095 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1246 aa  44.3  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  27.2 
 
 		 911 aa  43.9  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1275 aa  43.5  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>