More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6168 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.97 
 
 
259 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.947162  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2755  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
259 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
255 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
255 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618168  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
255 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.224785 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5975  NAD/NADP dependent oxidoreductase  50 
 
 
255 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2051  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
255 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.641389  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
279 aa  221  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.343653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
254 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
248 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
252 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
250 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
249 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
251 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
253 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  39.45 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 
255 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
250 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
251 aa  146  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
257 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
257 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
260 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
265 aa  145  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.39 
 
 
252 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
247 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
249 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
271 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
259 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
250 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
256 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
249 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
260 aa  142  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
250 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3193  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
255 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  33.33 
 
 
247 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.57 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.6 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  33.99 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1543  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.16 
 
 
260 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
252 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  38.34 
 
 
254 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
266 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
271 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  35.6 
 
 
261 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
252 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
257 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
256 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
253 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
283 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
255 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
260 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0705  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.43 
 
 
256 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539769  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2220  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.59 
 
 
260 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
253 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
251 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
252 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
257 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
282 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  35 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
247 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
245 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
252 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.88 
 
 
249 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.98 
 
 
260 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
252 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
263 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 
263 aa  135  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 
263 aa  135  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
244 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 
263 aa  135  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 
263 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
244 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
250 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>