More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6078 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  65.61 
 
 		 556 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  64.84 
 
 		 545 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  61.38 
 
 		 533 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  59.39 
 
 		 536 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 542 aa  1120    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  59.77 
 
 		 536 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  69.39 
 
 		 549 aa  799    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  63.21 
 
 		 533 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  62.62 
 
 		 545 aa  686    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  57.95 
 
 		 531 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  57.77 
 
 		 532 aa  590  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  55.47 
 
 		 529 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3955  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 508 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 508 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 		 504 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  37.5 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3271  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 508 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 499 aa  292  9e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 510 aa  292  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  35.62 
 
 		 503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 489 aa  290  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 526 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 505 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 537 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 525 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.24 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 494 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 525 aa  273  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 490 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0653  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 524 aa  272  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0632  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 532 aa  272  9e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 517 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.65 
 
 		 519 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1730  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.69 
 
 		 565 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 525 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 523 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  32.95 
 
 		 514 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1782  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 493 aa  262  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0876128  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.83 
 
 		 518 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 515 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.62 
 
 		 527 aa  257  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 508 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 519 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.05 
 
 		 504 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.51 
 
 		 518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.5 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 		 530 aa  253  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.09 
 
 		 576 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.07 
 
 		 518 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.29 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.96 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 544 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 551 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 534 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 524 aa  249  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.08 
 
 		 518 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 511 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4121  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 505 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.396047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.64 
 
 		 556 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.64 
 
 		 556 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.64 
 
 		 556 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 576 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 576 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 521 aa  248  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 576 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 576 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 576 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 570 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.89 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 518 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 520 aa  246  6e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.04 
 
 		 563 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  32.35 
 
 		 576 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 513 aa  246  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.86 
 
 		 561 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 509 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.61 
 
 		 561 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>