More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4718 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4718  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.721084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6693  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.03 
 
 		 190 aa  147  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3097  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6400  lysine exporter protein LysE/YggA  32.06 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  30.1 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003257  threonine efflux protein  32.2 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3113  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 		 209 aa  99.4  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.050755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0100  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2963  lysine exporter protein LysE/YggA  30.14 
 
 		 215 aa  98.2  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2959  putative threonine efflux protein  30.09 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3293  threonine efflux protein, putative  30.09 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2129  putative threonine efflux protein  30.09 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0428  LysE type translocator  30.09 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0377494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3387  putative threonine efflux protein  30.09 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0246  LysE family translocator protein  30.09 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  32.08 
 
 		 206 aa  94.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.81 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  29.72 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.81 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.81 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  30.81 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  30.33 
 
 		 206 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  29.86 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  30.33 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  29.86 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  29.86 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0468  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 215 aa  91.3  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.521562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  27.05 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3997  threonine efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0219  threonine efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  29.05 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  28.44 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  27.88 
 
 		 206 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.71 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2542  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  29.47 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0721  amino acid efflux pump, RhtB family protein  28 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.914234  normal  0.346615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  28.99 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0029  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.69 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  31.55 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2239  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.34 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.678713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7118  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.59 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.41 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3537  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.27 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.575737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43570  hypothetical protein  31.47 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.443465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  30.73 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0912  lysine exporter protein LysE/YggA  29.06 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  32.32 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4166  lysine exporter protein LysE/YggA  33.98 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  0.273019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  29.47 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2794  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.5 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.940238  normal  0.870805 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  31.8 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05080  putative threonine efflux protein  25.47 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5142  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  25.76 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.58 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  27.5 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  28.87 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1050  lysine exporter protein LysE/YggA  28.65 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2930  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000123984  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4978  lysine exporter protein LysE/YggA  28.04 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3692  lysine exporter protein (LysE/YggA)  28.87 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2617  lysine exporter protein LysE/YggA  26.84 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3712  lysine exporter protein LysE/YggA  31.12 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  25.5 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3653  hypothetical protein  30.26 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2347  lysine exporter protein LysE/YggA  26.46 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.09 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.36 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5115  lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.41 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3657  amino acid transporter LysE  28.9 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  30.46 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  29.9 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3991  lysine exporter protein LysE/YggA  27.07 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.1147  normal  0.39027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  29.33 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3076  lysine exporter protein LysE/YggA  25.74 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  26.7 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5054  lysine exporter protein LysE/YggA  29.7 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199833  normal  0.295211 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  30.15 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  26.6 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  25.49 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>