More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4421 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
425 aa  882    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  59.43 
 
 
424 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  60.85 
 
 
425 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  59 
 
 
424 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  57.35 
 
 
425 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  57.35 
 
 
424 aa  494  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  59.72 
 
 
424 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  56.87 
 
 
424 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
425 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  48.82 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
425 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  47.76 
 
 
444 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  47.76 
 
 
444 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  47.29 
 
 
425 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  48.11 
 
 
424 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  47.89 
 
 
444 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  47.03 
 
 
427 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  48.82 
 
 
424 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
441 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 
441 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  47.87 
 
 
424 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 
431 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 
429 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 
429 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  46.64 
 
 
430 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 
427 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 
432 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
430 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
434 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 
435 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
430 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
425 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
434 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
434 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.68 
 
 
430 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  34.32 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  35.45 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
430 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  35.21 
 
 
468 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 
434 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  35.14 
 
 
443 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
449 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  35.21 
 
 
468 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
437 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
424 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.93 
 
 
431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 
441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 
431 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.23 
 
 
430 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.23 
 
 
430 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
431 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
435 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  33.6 
 
 
430 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  32.17 
 
 
449 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.23 
 
 
430 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 
439 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  31.9 
 
 
452 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.94 
 
 
439 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
435 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.41 
 
 
437 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
429 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
445 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
434 aa  193  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
428 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 
429 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
433 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 
433 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
423 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
442 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
436 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
431 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 
430 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
423 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 
421 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 
437 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 
453 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.14 
 
 
439 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  34.41 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 
429 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 
430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 
435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 
433 aa  183  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
435 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
436 aa  183  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.57 
 
 
438 aa  182  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
435 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 
435 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
429 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.47 
 
 
426 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>