More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1092 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  88.72 
 
 		 197 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  51.61 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  54.5 
 
 		 198 aa  201  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  51.31 
 
 		 195 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  48.17 
 
 		 195 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  49.47 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  47.12 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  46.11 
 
 		 199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  46.32 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.6 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  45.6 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  45.79 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 		 199 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  47.87 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  48.11 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  46.6 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  46.6 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  46.6 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  46.6 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  44.27 
 
 		 198 aa  168  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  45.05 
 
 		 191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  45.05 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  44.81 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  45.05 
 
 		 191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  45.05 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  45.05 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 196 aa  162  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 		 209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 193 aa  160  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  46.32 
 
 		 195 aa  158  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  46.03 
 
 		 193 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 		 193 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  44.2 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  44.2 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  44.2 
 
 		 191 aa  158  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  44.2 
 
 		 191 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  43.65 
 
 		 191 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  49.16 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 200 aa  148  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  48.17 
 
 		 196 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  40.44 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  40.44 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 		 335 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  41.62 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  39.55 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  35.79 
 
 		 206 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  40.11 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  36.41 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5700  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  41.88 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65710  adenosine diphosphate sugar pyrophosphatase  41.88 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  34.38 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0547  hypothetical protein  38.79 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0608  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  37.82 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4973  mutT/nudix family protein  38.65 
 
 		 205 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4972  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3558  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.411557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4711  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.754787 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  34.69 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4919  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4795  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0027  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 213 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.87 
 
 		 210 aa  107  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.65 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3443  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.05 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0370  ADP-ribose pyrophosphatase  33.85 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.58 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3436  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.05 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3366  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.05 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3371  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  35.05 
 
 		 210 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.337716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  32.98 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1992  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  37.74 
 
 		 375 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3047  ADP-ribose diphosphatase  34.03 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000114185  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4267  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.55 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3538  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  34.54 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>