50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4036 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  100 
 
 		 516 aa  1006    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  58.87 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  53.33 
 
 		 506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  46.68 
 
 		 565 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  47.58 
 
 		 517 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  45.31 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  46.87 
 
 		 517 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  44.9 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  31.14 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  32.05 
 
 		 605 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  28.8 
 
 		 560 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  27.02 
 
 		 595 aa  75.1  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  26.92 
 
 		 607 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  30.38 
 
 		 594 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  25.05 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  24.18 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  23.64 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  24.06 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  25.79 
 
 		 595 aa  57  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  26.02 
 
 		 589 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  23.84 
 
 		 556 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  29.74 
 
 		 512 aa  54.3  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  24.93 
 
 		 592 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  24.93 
 
 		 592 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 592 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  33.93 
 
 		 544 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  29.8 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  29.8 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  29.8 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  29.8 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  29.8 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  29.8 
 
 		 595 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  40.66 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  28.76 
 
 		 590 aa  51.6  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  41.25 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  29.55 
 
 		 661 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  24.77 
 
 		 592 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  24.1 
 
 		 593 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  23.83 
 
 		 592 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  29.41 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  24.5 
 
 		 592 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  41.67 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  27.42 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 754 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  24.23 
 
 		 561 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  36.59 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.83 
 
 		 456 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>