More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5244 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  84.52 
 
 		 326 aa  554  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  70.31 
 
 		 322 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  58.19 
 
 		 337 aa  354  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  54.45 
 
 		 328 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  55.67 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  52.65 
 
 		 325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  52.08 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  46.75 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  47.02 
 
 		 326 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  52.63 
 
 		 353 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.63 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  48.63 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  52.63 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  47.02 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  48.03 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  46.71 
 
 		 322 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  48.14 
 
 		 331 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  45.66 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  47.56 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  47.85 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  47.85 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.95 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  43.73 
 
 		 318 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  45.83 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  45.36 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  45.69 
 
 		 344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  48.65 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.12 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  48.52 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.69 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  48 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  48 
 
 		 322 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.71 
 
 		 339 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.16 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.64 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  47.93 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  47.52 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  46.58 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  48.15 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  46.86 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  50.37 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  44.87 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  43.92 
 
 		 320 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  43.92 
 
 		 320 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  46.08 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.3 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  45.58 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.43 
 
 		 355 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.98 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.05 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  44.77 
 
 		 325 aa  261  8e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  42.49 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.69 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.67 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  45.54 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  44.7 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  45.03 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.37 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  44.95 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.18 
 
 		 335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.38 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.41 
 
 		 333 aa  258  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.83 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.83 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  44.44 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  45.55 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.04 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  42.17 
 
 		 347 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.81 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.92 
 
 		 326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.64 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  41.08 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.15 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  43.41 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  40.8 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.47 
 
 		 335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.64 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  42.52 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.91 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.79 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  43.64 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.34 
 
 		 356 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  45.17 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.58 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.68 
 
 		 327 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  42.12 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  41.89 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.87 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  43.15 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.78 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.67 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  43 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  41.81 
 
 		 339 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.62 
 
 		 333 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4444  extra-cytoplasmic solute receptor  42.36 
 
 		 323 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.99 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  42.05 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>