More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4788 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  50.83 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.41 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  39.41 
 
 		 343 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.44 
 
 		 331 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.98 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.98 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  37.95 
 
 		 328 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5624  hypothetical protein  38.96 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  38.84 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  35.94 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.95 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.13 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.93 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  38.59 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.78 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  38.2 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.28 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.59 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.77 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  41.22 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  39.6 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.81 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  37.93 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.62 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  39.25 
 
 		 336 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  34.8 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.05 
 
 		 358 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.16 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.68 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  39.07 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  38.46 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  36.13 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  37.27 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  37.46 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0286  hypothetical protein  39.13 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.89 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  36.14 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.5 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.58 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  36.84 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.18 
 
 		 339 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  39.26 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  35.62 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.67 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  38.19 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  34.9 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  35.19 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  37.13 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.36 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  37.86 
 
 		 329 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  37.01 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  34.23 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.29 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  36.83 
 
 		 333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  34.98 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  36.91 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  35.38 
 
 		 323 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  36.24 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.25 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.04 
 
 		 326 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  37.13 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.05 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.65 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.28 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  36.11 
 
 		 320 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  37.92 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.98 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.2 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  35.6 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  34.93 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  35.91 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  38.75 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  36.56 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  34.9 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  37.83 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  37.5 
 
 		 332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  34.98 
 
 		 345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  37.86 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  36.11 
 
 		 337 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  34.11 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  35.69 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  36.93 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3194  hypothetical protein  38.51 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195792  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 		 335 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  34.08 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  34.46 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  35.94 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4115  hypothetical protein  33.93 
 
 		 336 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  36.75 
 
 		 332 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  35.19 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  35.22 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  33.13 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  33.75 
 
 		 323 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>