More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3750 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4363  FAD dependent oxidoreductase  67.61 
 
 		 471 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3750  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 479 aa  992    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2003  FAD dependent oxidoreductase  66.96 
 
 		 471 aa  638    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6224  FAD dependent oxidoreductase  65.27 
 
 		 473 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0685  putative taurine dehydrogenase, large subunit  67.4 
 
 		 472 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  65.43 
 
 		 473 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4526  FAD dependent oxidoreductase  66.3 
 
 		 469 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.719592  normal  0.292372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3850  FAD dependent oxidoreductase  63.99 
 
 		 482 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3503  FAD dependent oxidoreductase  63.2 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4863  FAD dependent oxidoreductase  61.51 
 
 		 466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  62.02 
 
 		 464 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4289  FAD dependent oxidoreductase  60.52 
 
 		 499 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0106855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  60.52 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1829  putative FAD-dependent oxidoreductase  59.91 
 
 		 464 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.226522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1643  FAD dependent oxidoreductase  63.7 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4759  FAD dependent oxidoreductase  61.44 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4012  FAD dependent oxidoreductase  61.3 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1461  putative oxidoreductase  41.68 
 
 		 454 aa  365  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3398  FAD dependent oxidoreductase  38.38 
 
 		 442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2458  FAD dependent oxidoreductase  37.58 
 
 		 442 aa  280  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0489  FAD dependent oxidoreductase  37.04 
 
 		 446 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01621  putative oxidoreductase  34.92 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0954  FAD dependent oxidoreductase  35.82 
 
 		 445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.650756  normal  0.921941 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.52 
 
 		 426 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.78 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.78 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.78 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.78 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.78 
 
 		 426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.78 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 424 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 442 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2980  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.104228  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.23 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 424 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 433 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  31.59 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 425 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.83 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 444 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 425 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 425 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 445 aa  152  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 433 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  28.76 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.4 
 
 		 437 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  29.75 
 
 		 424 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  30.7 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  29.51 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.33 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.35 
 
 		 427 aa  148  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 449 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 435 aa  146  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 425 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  30.15 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  28.99 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>