More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0269 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0269  DNA-binding transcriptional activator MhpR  100 
 
 		 260 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4534  DNA-binding transcriptional activator MhpR  79.46 
 
 		 296 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2330  DNA-binding transcriptional activator MhpR  78.08 
 
 		 270 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0897  DNA-binding transcriptional activator MhpR  52.94 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000478423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15090  DNA-binding transcriptional activator MhpR  55.2 
 
 		 273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0421  DNA-binding transcriptional activator MhpR  50.2 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.455857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0377  DNA-binding transcriptional activator MhpR  50.2 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000713598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3279  DNA-binding transcriptional activator MhpR  50.2 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000040145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0370  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.8 
 
 		 315 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000653427  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0410  DNA-binding transcriptional activator MhpR  49.8 
 
 		 315 aa  252  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000385619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00300  DNA-binding transcriptional activator, 3HPP-binding  49.8 
 
 		 315 aa  251  7e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000821038  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3260  transcriptional regulator, IclR family  49.8 
 
 		 281 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000124832  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00304  hypothetical protein  49.8 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000752199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1978  DNA-binding transcriptional activator MhpR  50.39 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184195  normal  0.111389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0931  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.83 
 
 		 266 aa  235  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0051  DNA-binding transcriptional activator MhpR  47.6 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0926  DNA-binding transcriptional activator MhpR  38.7 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7402  Transcriptional regulator  37.55 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0834  DNA-binding transcriptional activator MhpR  35.69 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7409  Transcriptional regulator  36.78 
 
 		 285 aa  128  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3062  DNA-binding transcriptional activator MhpR  31.37 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0344191 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3751  DNA-binding transcriptional activator MhpR  32.02 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3024  DNA-binding transcriptional activator MhpR  32.02 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2678  transcriptional regulator for mhp operon  32.77 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3992  transcriptional regulator, IclR family  32.62 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1863  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020859  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1685  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.857691  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1215  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.39348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2112  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4595  regulatory protein, IclR  30.32 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 567 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1199  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.960653  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6045  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.820447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1173  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0673646 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2103  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1756  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  26 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0720  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7315  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  27.64 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.67 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1174  IclR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0720169  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1578  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1769  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1231  IclR family transcriptional regulator  28 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.418488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2906  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102633  normal  0.6854 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1081  IclR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1081  IclR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.176938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  28.4 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4127  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  23.83 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4359  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.274629  normal  0.552414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2760  hypothetical protein  29.41 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.202707  normal  0.0135051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2125  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0297  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0530  regulatory protein, IclR  30.37 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38230  Transcriptional regulator PcaR  27.27 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1502  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.142531  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2865  transcriptional regulator, putative  26.07 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1366  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0501945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1370  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 275 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  23.26 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4308  IclR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000933237  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43430  IclR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0906  regulatory proteins, IclR  27.95 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.82 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0362  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  26.88 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  26.88 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2498  regulatory proteins, IclR  27.42 
 
 		 635 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0532192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0201  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1817  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109987  normal  0.0137761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3643  putative transcriptional regulator  25.68 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>