More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3462 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  100 
 
 		 412 aa  804    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  84.98 
 
 		 407 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  57.11 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 411 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 397 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  37.88 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 406 aa  222  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 		 399 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  33.84 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  33 
 
 		 410 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  32.11 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  34.34 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  34.34 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  34.34 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  34.34 
 
 		 408 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  34.09 
 
 		 408 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 416 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  34.5 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  33.95 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  35.34 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  35.34 
 
 		 404 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  35.34 
 
 		 404 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  35.09 
 
 		 404 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  33.42 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  33.5 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  33.42 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  33.42 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  33.42 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  31.94 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  35.09 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  33.42 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  33.07 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  33.42 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  33.17 
 
 		 404 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  32.38 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  35.08 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  32.38 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  30.99 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  29.92 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 407 aa  169  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  26.32 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  31.53 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  25.81 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 450 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  30.29 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  27.07 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  26.29 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  24.69 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  27.43 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 447 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 416 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  25.87 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  27.14 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  21.53 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>