88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0820 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0468  iron permease FTR1  55.15 
 
 		 820 aa  779    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.402804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0820  iron permease FTR1  100 
 
 		 782 aa  1560    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.594209  hitchhiker  0.0000623566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4468  iron permease FTR1  74.58 
 
 		 779 aa  1058    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.390175  normal  0.0190609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5728  iron permease FTR1  46.16 
 
 		 846 aa  602  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2435  iron permease FTR1  45.42 
 
 		 743 aa  547  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2330  High-affinity Fe2+/Pb2+ permease-like protein  39.79 
 
 		 325 aa  189  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00178906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0164  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.21 
 
 		 653 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00534559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2017  iron permease FTR1  29.43 
 
 		 413 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00650927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  29.33 
 
 		 636 aa  103  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1783  iron permease FTR1  29.34 
 
 		 634 aa  101  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.498306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  29.33 
 
 		 647 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1170  iron permease, FTR1 family  27.83 
 
 		 691 aa  99.8  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.900718  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2353  permease  28.52 
 
 		 653 aa  99.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69300  hypothetical protein  27.03 
 
 		 633 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5282  iron permease FTR1  27.57 
 
 		 642 aa  97.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1641  iron permease FTR1  27.57 
 
 		 642 aa  97.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  28.8 
 
 		 647 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2302  iron permease FTR1  30.58 
 
 		 652 aa  95.9  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1385  iron permease FTR1  28.19 
 
 		 634 aa  95.9  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5350  iron permease FTR1  28.68 
 
 		 640 aa  95.1  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.620494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0433  fumarate hydratase class II (fumarase C)  26.71 
 
 		 646 aa  95.1  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0141  lead uptake protein, putative  31.75 
 
 		 632 aa  94  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2141  FTR1 family iron permease  26.65 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5993  hypothetical protein  28.57 
 
 		 652 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2132  FTR1 family iron permease  26.65 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0517239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2151  iron permease FTR1  27.14 
 
 		 643 aa  93.6  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.301053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2809  Iron permease FTR1  28.8 
 
 		 660 aa  93.2  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2252  iron permease FTR1  26.42 
 
 		 639 aa  92.4  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0763  superoxide dismutase  26.73 
 
 		 647 aa  91.7  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.745778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0049  cytochrome c, class I:Iron permease FTR1  32.05 
 
 		 632 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1817  iron permease FTR1  27.52 
 
 		 640 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.214502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 631 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5945  Pb(II)-uptake protein PbrT  27.13 
 
 		 642 aa  89  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.925731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1022  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  29.17 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2018  FTR1 family iron permease  27.94 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3637  iron permease FTR1  29.13 
 
 		 664 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1240  iron permease FTR1  27.34 
 
 		 644 aa  84  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1649  FTR1 family iron permease  27.62 
 
 		 696 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2692  iron permease FTR1  29.12 
 
 		 273 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1830  FTR1 family iron permease  27.62 
 
 		 696 aa  83.6  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0292  iron permease FTR1  28.45 
 
 		 629 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0723  cytochrome c, class I  28.33 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694021  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0450  FTR1 family iron permease  25.23 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168197  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2561  iron permease FTR1  29.88 
 
 		 647 aa  75.5  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0160  iron permease FTR1 family protein  26.67 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.31653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2954  iron permease FTR1  24.13 
 
 		 652 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1058  iron permease FTR1  26.57 
 
 		 683 aa  73.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0352795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1883  iron permease FTR1  24.91 
 
 		 645 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0482  iron permease FTR1  27.1 
 
 		 649 aa  72.8  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1510  hypothetical protein  26.52 
 
 		 422 aa  72  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000353289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0822  iron permease FTR1  31.5 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0839  iron permease FTR1  27.85 
 
 		 308 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2443  iron permease FTR1  29.55 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0524  FTR1 family iron permease  26.69 
 
 		 637 aa  68.2  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.210875  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1953  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  27.74 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.002939  normal  0.431592 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1255  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  22.9 
 
 		 603 aa  67.8  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2612  iron permease FTR1  27.73 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000110205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0393  hypothetical protein  21.77 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0403  hypothetical protein  21.77 
 
 		 570 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1733  iron permease FTR1  28.34 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.997501  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1936  iron permease FTR1  28.86 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0480645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3143  iron permease FTR1  30.15 
 
 		 281 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5686  iron permease FTR1  25.23 
 
 		 287 aa  56.2  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4913  iron permease FTR1  29.02 
 
 		 579 aa  54.3  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2602  iron permease FTR1  23.94 
 
 		 239 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5173  iron permease FTR1  27.57 
 
 		 314 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000262497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3473  iron permease FTR1  24.87 
 
 		 308 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2597  Iron permease FTR1  26.77 
 
 		 290 aa  51.2  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3898  iron permease FTR1  25.7 
 
 		 537 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2929  iron permease FTR1  26.32 
 
 		 281 aa  50.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00359497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1789  iron permease FTR1  26.9 
 
 		 315 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3314  iron permease FTR1  27.27 
 
 		 281 aa  49.7  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4287  iron permease FTR1  29.76 
 
 		 290 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3596  hypothetical protein  31.51 
 
 		 284 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3367  Iron permease FTR1  29.45 
 
 		 284 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25520  high-affinity Fe2+/Pb2+ permease  33.1 
 
 		 294 aa  47.8  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0297463  normal  0.133563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0188  iron permease FTR1  25.85 
 
 		 283 aa  48.1  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0228999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1981  iron permease FTR1  29.39 
 
 		 276 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1568  iron permease FTR1  24.26 
 
 		 304 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1763  Iron permease FTR1  25.6 
 
 		 315 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1954  iron permease FTR1  31.16 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.860822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3859  iron permease FTR1  29.29 
 
 		 280 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.627947  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2258  iron permease FTR1  29.39 
 
 		 276 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3323  iron permease FTR1  27.75 
 
 		 307 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2366  iron permease FTR1  27.78 
 
 		 282 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0450502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1811  iron permease FTR1  28.14 
 
 		 283 aa  44.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.668278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2040  ferrous iron permease EfeU  27.27 
 
 		 285 aa  44.7  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2264  ferrous iron permease EfeU  27.78 
 
 		 282 aa  44.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>