48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0201 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  100 
 
 		 793 aa  1571    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  61.66 
 
 		 1159 aa  776    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  54.34 
 
 		 401 aa  333  7.000000000000001e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  52.16 
 
 		 406 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  49.65 
 
 		 309 aa  262  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  45.87 
 
 		 364 aa  260  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  47.59 
 
 		 433 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  48.29 
 
 		 369 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  51.15 
 
 		 318 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  54.5 
 
 		 1597 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  44.27 
 
 		 339 aa  213  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  52.17 
 
 		 1708 aa  201  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  33.97 
 
 		 4357 aa  78.2  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.19 
 
 		 306 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  61.96 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  25.74 
 
 		 3907 aa  61.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.3 
 
 		 11716 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  40.37 
 
 		 675 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  67.14 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  58.33 
 
 		 453 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  59 
 
 		 1394 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1367 aa  53.9  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1461  hypothetical protein  26.34 
 
 		 786 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.05 
 
 		 4761 aa  51.6  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3449  hypothetical protein  30.72 
 
 		 491 aa  51.2  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.6 
 
 		 598 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 643 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  46.84 
 
 		 812 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1016  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  31.16 
 
 		 1265 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.68 
 
 		 2449 aa  49.3  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0516  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.99 
 
 		 474 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1576 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.86 
 
 		 1424 aa  47.8  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4731  hypothetical protein  32 
 
 		 2223 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  51.69 
 
 		 521 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.49 
 
 		 236 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  49.4 
 
 		 735 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  29.19 
 
 		 6678 aa  47  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  50 
 
 		 942 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  26.47 
 
 		 911 aa  45.8  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  29.05 
 
 		 2503 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1913  hypothetical protein  50.5 
 
 		 337 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00733934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.81 
 
 		 1565 aa  45.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.38 
 
 		 3699 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.71 
 
 		 599 aa  44.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5363  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  30.08 
 
 		 265 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0573653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.3 
 
 		 594 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0545  hypothetical protein  40 
 
 		 570 aa  44.3  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>