147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3030 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  44.06 
 
 		 1534 aa  1268    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  100 
 
 		 1582 aa  3181    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  48.03 
 
 		 1521 aa  1379    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  64.77 
 
 		 1603 aa  2011    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  88.83 
 
 		 1594 aa  2839    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  48.56 
 
 		 1516 aa  1363    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  48.2 
 
 		 1516 aa  1363    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  44.12 
 
 		 1504 aa  1271    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  44.25 
 
 		 1504 aa  1275    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  63.84 
 
 		 1596 aa  1995    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  44.12 
 
 		 1504 aa  1271    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  44.32 
 
 		 1504 aa  1276    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  88.58 
 
 		 1594 aa  2840    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  44.05 
 
 		 1478 aa  1247    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  44.06 
 
 		 1534 aa  1268    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.65 
 
 		 1737 aa  252  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  25.15 
 
 		 1559 aa  234  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.35 
 
 		 1704 aa  214  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.05 
 
 		 2191 aa  169  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.33 
 
 		 2195 aa  161  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.81 
 
 		 2002 aa  155  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.64 
 
 		 1821 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.73 
 
 		 2002 aa  134  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.85 
 
 		 1534 aa  121  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.85 
 
 		 1534 aa  118  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24 
 
 		 1872 aa  107  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.37 
 
 		 2125 aa  104  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.94 
 
 		 1916 aa  100  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.4 
 
 		 1628 aa  97.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.56 
 
 		 1906 aa  95.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  24.47 
 
 		 1869 aa  95.5  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  22.56 
 
 		 2002 aa  90.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.32 
 
 		 1307 aa  87  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.5 
 
 		 1352 aa  86.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.04 
 
 		 1927 aa  86.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.34 
 
 		 2000 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.15 
 
 		 1994 aa  82.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1921 aa  81.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  20.46 
 
 		 1637 aa  80.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.6 
 
 		 1925 aa  79.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1921 aa  78.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.79 
 
 		 2057 aa  76.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  23.69 
 
 		 1993 aa  77  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.42 
 
 		 2022 aa  73.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.05 
 
 		 1768 aa  73.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.81 
 
 		 1635 aa  72  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.16 
 
 		 2006 aa  71.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.21 
 
 		 1859 aa  70.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.96 
 
 		 1641 aa  70.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.83 
 
 		 1999 aa  69.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.36 
 
 		 2020 aa  69.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.6 
 
 		 1992 aa  69.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.98 
 
 		 1785 aa  69.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1077  alpha-2-macroglobulin family protein  24.04 
 
 		 1717 aa  69.3  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0094392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.47 
 
 		 1998 aa  68.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.6 
 
 		 1992 aa  68.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1641 aa  66.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.78 
 
 		 1619 aa  65.9  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.18 
 
 		 1971 aa  65.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.28 
 
 		 1872 aa  65.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  24.39 
 
 		 2016 aa  64.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.11 
 
 		 1971 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  24 
 
 		 1897 aa  65.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.71 
 
 		 1765 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  26.33 
 
 		 1974 aa  63.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.37 
 
 		 2173 aa  63.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.28 
 
 		 1872 aa  63.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1921 aa  62.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1898 aa  62.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  24.53 
 
 		 1925 aa  62.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.78 
 
 		 1708 aa  62.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.71 
 
 		 2025 aa  62  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.36 
 
 		 1953 aa  62  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.93 
 
 		 1823 aa  61.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  24.15 
 
 		 1738 aa  61.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  24.04 
 
 		 1411 aa  61.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  22.48 
 
 		 2000 aa  61.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.48 
 
 		 2000 aa  61.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.7 
 
 		 1697 aa  61.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  24.58 
 
 		 1737 aa  60.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1743 aa  60.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  22.26 
 
 		 2067 aa  59.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  25 
 
 		 1737 aa  59.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  22.08 
 
 		 2053 aa  59.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  24.74 
 
 		 1979 aa  58.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  23.06 
 
 		 1727 aa  58.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  30.15 
 
 		 1994 aa  58.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  26.29 
 
 		 1403 aa  57.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.09 
 
 		 2013 aa  57.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  22.32 
 
 		 2050 aa  57.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  22.95 
 
 		 2055 aa  57  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  22.95 
 
 		 2055 aa  57  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  23.18 
 
 		 2057 aa  57  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  26.27 
 
 		 1748 aa  57  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.42 
 
 		 2013 aa  56.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.75 
 
 		 1737 aa  56.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  24.56 
 
 		 1815 aa  56.2  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 1665 aa  55.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  25.39 
 
 		 2019 aa  54.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  23.3 
 
 		 1805 aa  53.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>