More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03123 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  100 
 
 		 279 aa  563  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 394 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  27.78 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 283 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  27.24 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  29.79 
 
 		 283 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  29.79 
 
 		 287 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.46 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 283 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  38.84 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  28.57 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  38.02 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.87 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  36.72 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.84 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.55 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25.45 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.98 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.55 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  25.83 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  25.37 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.2 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.01 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  31.13 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  26.1 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1274  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.576034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.51 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.25 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  33.33 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  33.64 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  23.84 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  39.62 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  24.62 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.67 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.67 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  25.26 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  32.73 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  31.82 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  24.81 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.18 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 270 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  36.44 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>