More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4327 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  287  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  70.54 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  64.93 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  61.48 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  62.94 
 
 		 147 aa  166  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  60 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 149 aa  87.8  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 151 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  38.53 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  37.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  37.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  37.61 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  40.78 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  37.63 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  50.67 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  37.96 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  35.19 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  33.67 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  33.67 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  33.67 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  35.19 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  38.98 
 
 		 473 aa  60.1  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  38.68 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1011  GDP-mannose mannosyl hydrolase  33.65 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  36.07 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2986  GDP-mannose mannosyl hydrolase  33.65 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1590  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  25.98 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  25.98 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  25.98 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2344  GDP-mannose mannosyl hydrolase  32.69 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1181  GDP-mannose mannosyl hydrolase  33.33 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  25.2 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 163 aa  57  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  40.79 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>