71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0777 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  495  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  75.98 
 
 		 261 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  73.26 
 
 		 261 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  73.68 
 
 		 250 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  72.43 
 
 		 244 aa  343  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  65.84 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  50.2 
 
 		 251 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  48.92 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  47.84 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  47.84 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  46.41 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4663  hypothetical protein  45.99 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0947  protein of unknown function DUF81  50.46 
 
 		 250 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2148  protein of unknown function DUF81  43.78 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  41.35 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3822  hypothetical protein  47.27 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  43.75 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  43.75 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  43.75 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0773  hypothetical protein  44.77 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0716  hypothetical protein  47.03 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  45.15 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4042  hypothetical protein  45.15 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  43.38 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0795  hypothetical protein  48.66 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4492  hypothetical protein  45.8 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3101  protein of unknown function DUF81  41.63 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4034  hypothetical protein  43.48 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1237  hypothetical protein  44.96 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.318719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3543  protein of unknown function DUF81  44.29 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2113  hypothetical protein  42.49 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03620  hypothetical protein  46.58 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0487694  hitchhiker  0.00000000539148 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3331  protein of unknown function DUF81  40 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2216  hypothetical protein  43.84 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.86715  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0979  hypothetical protein  40.43 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2134  hypothetical protein  43.4 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2443  hypothetical protein  44.35 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.97715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2576  hypothetical protein  43.55 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0354  hypothetical protein  40.22 
 
 		 194 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0685  hypothetical protein  41.45 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2458  hypothetical protein  37.72 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210004  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  29.24 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0369  hypothetical protein  69.81 
 
 		 61 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.660019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4638  hypothetical protein  27.43 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0730129  hitchhiker  0.00519194 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1430  hypothetical protein  21.05 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  31.45 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3052  hypothetical protein  32.2 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  26.64 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1832  hypothetical protein  26.67 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.30678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6050  protein of unknown function DUF81  27.23 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1367  hypothetical protein  25.45 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.113148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0252  protein of unknown function DUF81  21.67 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1676  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2117  hypothetical protein  26.09 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  26.05 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1090  hypothetical protein  27.71 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.459295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2283  hypothetical protein  25.7 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  29.61 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0494  hypothetical protein  24.39 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.514524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  26.11 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.53 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1837  hypothetical protein  42.37 
 
 		 83 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  24.59 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  26.11 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>