203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2478 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3473  Organic solvent tolerance protein  84.41 
 
 		 837 aa  1441    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1679  organic solvent tolerance protein  70.17 
 
 		 829 aa  1187    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2836  organic solvent tolerance protein  48.71 
 
 		 842 aa  758    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324598  normal  0.142407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2478  organic solvent tolerance protein  100 
 
 		 833 aa  1712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2311  organic solvent tolerance protein  76.08 
 
 		 842 aa  1256    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2968  organic solvent tolerance protein  91.72 
 
 		 833 aa  1541    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.61435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2342  organic solvent tolerance protein  71.84 
 
 		 831 aa  1207    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3829  putative organic solvent tolerance protein OstA (ImpA)  69.76 
 
 		 861 aa  1173    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216689  normal  0.0687208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5838  Organic solvent tolerance protein  40.41 
 
 		 886 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0554  organic solvent tolerance protein  42.07 
 
 		 859 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.952449  normal  0.0626467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3648  organic solvent tolerance protein  40.39 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3941  Organic solvent tolerance protein  40.28 
 
 		 876 aa  602  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.911669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3931  Organic solvent tolerance protein  40.78 
 
 		 862 aa  598  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.748868  normal  0.188644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5100  organic solvent tolerance protein  39.76 
 
 		 886 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2223  Organic solvent tolerance protein  41.1 
 
 		 889 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.653366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0652  organic solvent tolerance protein  40.56 
 
 		 892 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2603  organic solvent tolerance protein  38.6 
 
 		 786 aa  560  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0685  organic solvent tolerance, putative  38.53 
 
 		 792 aa  552  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0677  putative organic solvent tolerance  38.53 
 
 		 792 aa  549  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1541  organic solvent tolerance protein  38.44 
 
 		 777 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1066  Organic solvent tolerance protein  39.39 
 
 		 780 aa  519  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1210  Organic solvent tolerance protein  38.45 
 
 		 776 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44229  hitchhiker  0.00000306995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1759  organic solvent tolerance protein  37.11 
 
 		 786 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0763  organic solvent tolerance protein  34.41 
 
 		 781 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.169469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0506  organic solvent tolerance protein  34.1 
 
 		 791 aa  468  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3340  organic solvent tolerance protein  30.69 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1762  organic solvent tolerance protein  28.75 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.868226  normal  0.32659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2626  organic solvent tolerance protein  25.78 
 
 		 746 aa  260  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3044  Organic solvent tolerance protein  27.02 
 
 		 784 aa  254  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2528  organic solvent tolerance protein  26.05 
 
 		 816 aa  254  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0411  organic solvent tolerance protein  27.19 
 
 		 748 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.693712  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0434  organic solvent tolerance protein OstA-like  25.44 
 
 		 886 aa  228  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.435152  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1188  organic solvent tolerance protein  28.46 
 
 		 716 aa  221  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274723  normal  0.555926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2902  putative organic solvent tolerance protein  27.16 
 
 		 714 aa  218  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1546  organic solvent tolerance protein  27.16 
 
 		 714 aa  218  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0889  organic solvent tolerance protein  27.31 
 
 		 756 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1224  organic solvent tolerance protein  25.07 
 
 		 724 aa  208  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0104539  normal  0.332289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1812  organic solvent tolerance protein, putative  26.37 
 
 		 715 aa  204  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0780027  normal  0.530576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0900  organic solvent tolerance protein  24.36 
 
 		 804 aa  197  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.403582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0947  organic solvent tolerance protein  25.68 
 
 		 731 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0025554  normal  0.755835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1119  organic solvent tolerance protein  33.33 
 
 		 712 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.223918 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  22.24 
 
 		 780 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  32.35 
 
 		 791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  22.24 
 
 		 750 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  23.21 
 
 		 801 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  23.19 
 
 		 799 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  22.92 
 
 		 750 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  24.52 
 
 		 799 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  35.27 
 
 		 783 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  31.86 
 
 		 753 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  22.89 
 
 		 785 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  29.31 
 
 		 788 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  26.31 
 
 		 819 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  22.5 
 
 		 786 aa  105  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  31.41 
 
 		 820 aa  104  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00811  organic solvent tolerance protein  21.86 
 
 		 781 aa  104  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0098  organic solvent tolerance protein  22.5 
 
 		 786 aa  104  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00167743  normal  0.0233205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  28.97 
 
 		 789 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  24.35 
 
 		 764 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 		 786 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  22.38 
 
 		 786 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  29.41 
 
 		 787 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  29.11 
 
 		 786 aa  102  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  31.13 
 
 		 788 aa  101  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  28.91 
 
 		 784 aa  100  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  28.97 
 
 		 751 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  21.53 
 
 		 787 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  32.68 
 
 		 799 aa  100  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  29.35 
 
 		 786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2328  organic solvent tolerance protein  23.08 
 
 		 762 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 786 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  29.35 
 
 		 786 aa  99  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  28.37 
 
 		 774 aa  98.6  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  22.41 
 
 		 781 aa  99  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  28.2 
 
 		 810 aa  98.2  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  24.36 
 
 		 860 aa  97.8  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  33.48 
 
 		 774 aa  98.2  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.67 
 
 		 938 aa  97.8  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  26.65 
 
 		 937 aa  97.8  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  30.29 
 
 		 701 aa  97.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  30.29 
 
 		 727 aa  97.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  31.6 
 
 		 786 aa  96.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  30.7 
 
 		 787 aa  96.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  30.87 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  30.87 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  30.87 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  30.87 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  30.87 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  30.87 
 
 		 787 aa  95.9  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  26.02 
 
 		 766 aa  95.1  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  25.41 
 
 		 807 aa  95.5  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  24.22 
 
 		 822 aa  95.1  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  26.39 
 
 		 774 aa  94.7  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  26.02 
 
 		 766 aa  94  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  24.4 
 
 		 814 aa  92.8  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  31.62 
 
 		 761 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  28.18 
 
 		 773 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  27.6 
 
 		 784 aa  92.4  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>