More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0011 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  77.49 
 
 		 733 aa  1102    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 731 aa  1460    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  54.6 
 
 		 758 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  58.14 
 
 		 749 aa  744    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  81.12 
 
 		 735 aa  1192    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  94.66 
 
 		 731 aa  1375    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  55.14 
 
 		 743 aa  736    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  55.36 
 
 		 758 aa  663    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  91.26 
 
 		 732 aa  1305    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  49.1 
 
 		 728 aa  617  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  46.11 
 
 		 738 aa  598  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  44.05 
 
 		 752 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  45.92 
 
 		 724 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  44.05 
 
 		 752 aa  548  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  44.71 
 
 		 762 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  46.05 
 
 		 809 aa  545  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  45.49 
 
 		 729 aa  534  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 746 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 		 721 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  44.21 
 
 		 761 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  42.28 
 
 		 755 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  45.86 
 
 		 727 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 		 648 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  46.98 
 
 		 737 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  43.54 
 
 		 757 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  43.97 
 
 		 732 aa  522  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  42.93 
 
 		 787 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  46.36 
 
 		 737 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  46.5 
 
 		 737 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 731 aa  510  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  46.57 
 
 		 707 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.41 
 
 		 812 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  35.65 
 
 		 803 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 803 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  34.83 
 
 		 803 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.75 
 
 		 799 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  34.43 
 
 		 799 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 799 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  34.56 
 
 		 799 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 		 799 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  33.88 
 
 		 799 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 807 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  34.06 
 
 		 799 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.05 
 
 		 794 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 		 806 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.19 
 
 		 838 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  34.52 
 
 		 797 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 		 834 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.52 
 
 		 790 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  33.61 
 
 		 787 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.21 
 
 		 795 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  32.86 
 
 		 796 aa  402  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  31.6 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 		 839 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.83 
 
 		 828 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 813 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 		 792 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  33.33 
 
 		 787 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  35.61 
 
 		 846 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 826 aa  395  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 		 815 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  34.58 
 
 		 819 aa  392  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  32.78 
 
 		 791 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  33.79 
 
 		 792 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  33.1 
 
 		 791 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 		 824 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 790 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 743 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  35.42 
 
 		 882 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  36.52 
 
 		 740 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 800 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  37.08 
 
 		 800 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  34.54 
 
 		 811 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  35.42 
 
 		 824 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  35.53 
 
 		 765 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  34.45 
 
 		 777 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  35.65 
 
 		 814 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 811 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 741 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 		 806 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 		 847 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  36 
 
 		 748 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 		 732 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  35.92 
 
 		 792 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 816 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 813 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.3 
 
 		 797 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  35.65 
 
 		 792 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.56 
 
 		 806 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.16 
 
 		 817 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 847 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.81 
 
 		 797 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  36.57 
 
 		 823 aa  364  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  36.3 
 
 		 802 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  34.99 
 
 		 793 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 		 834 aa  361  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  31.42 
 
 		 814 aa  361  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 		 818 aa  361  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 		 760 aa  360  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  31.61 
 
 		 807 aa  360  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>