More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1921 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1921  metallopeptidase peptidase  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318807 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2214  peptidase M23B  91.84 
 
 		 198 aa  371  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0489  peptidase M23B  51.3 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2227  peptidase M23B  62.86 
 
 		 172 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3409  Peptidase M23  51.47 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01987  peptidase  44.29 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.517846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  41.22 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01485  peptidase  51.72 
 
 		 377 aa  107  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.3705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  50.88 
 
 		 392 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3011  Peptidase M23  40.48 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0127254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02339  M23 peptidase domain protein  42.97 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.213861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3804  peptidase M23B  44.8 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.019155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6234  Peptidase M23  42.61 
 
 		 446 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2717  Peptidase M23  45.69 
 
 		 272 aa  92  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000153286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3052  Peptidase M23  40.54 
 
 		 329 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73200  hypothetical protein  48.11 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0435  Peptidase M23  44.25 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0813  peptidase M23B  40.71 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31424  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  35.07 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2445  peptidase M23B  43.05 
 
 		 844 aa  82.8  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  39.42 
 
 		 386 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  38.46 
 
 		 386 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2907  Peptidase M23  39.42 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  43.69 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1360  Peptidase M23  43.24 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0288  peptidase M23B  43.88 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000254683  hitchhiker  0.00000000102715 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  37.86 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3731  peptidase M23B  39.17 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0375329  unclonable  0.0000231943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0288  peptidase M23B  39.17 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00195161  decreased coverage  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30.32 
 
 		 301 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.1 
 
 		 389 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3990  peptidase M23B  37.5 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  38.1 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  43 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4699  M24/M37 family peptidase  39.1 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0776348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0123  peptidase, M23/M37 family  39.1 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0859179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3584  peptidase M23B  38.89 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  43 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  30.86 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5110  M24/M37 family peptidase  38.35 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4841  M24/M37 family peptidase  38.35 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.024057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  37.62 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4420  M24/M37 family peptidase  41 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4683  M24/M37 family peptidase  38.35 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5077  peptidase, M23/M37 family  38.35 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5206  M23/37 family peptidase  38.35 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5115  peptidase, M23/M37 family  38.35 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000714252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5117  peptidase, M23/M37 family  38.35 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4797  peptidase M23B  37.59 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0231137  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  35.94 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.88 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  43 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  42.27 
 
 		 491 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  43 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3569  peptidase M23B  38.35 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  37.5 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  35.71 
 
 		 419 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0301  peptidase M23B  41.35 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  41 
 
 		 480 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  36.45 
 
 		 467 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  41.58 
 
 		 299 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  37.69 
 
 		 269 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.33 
 
 		 313 aa  71.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  42.86 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0403  peptidase M23B  41 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00242182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0305  Peptidase M23  43.48 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.56 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34.62 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0293  peptidase M23B  43.48 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000339642  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  33.83 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  36.36 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  34.59 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  34.88 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0300  peptidase M23B  45.56 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0390881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  33.87 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  38.02 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  36.54 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  37.5 
 
 		 446 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.36 
 
 		 490 aa  68.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.54 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.54 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  34.92 
 
 		 423 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.33 
 
 		 464 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  36.89 
 
 		 569 aa  68.6  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  32.82 
 
 		 402 aa  68.2  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.41 
 
 		 425 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  37.39 
 
 		 524 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  32.79 
 
 		 430 aa  67.8  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  36.51 
 
 		 272 aa  67.8  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  39 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  41 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  39 
 
 		 325 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.84 
 
 		 376 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  33.12 
 
 		 300 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  38.24 
 
 		 453 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  35.85 
 
 		 445 aa  67  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  38.14 
 
 		 464 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  41.75 
 
 		 323 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  33.56 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0197  peptidase M23B  35.48 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00125912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>