More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1183 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1183  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
560 aa  1154    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1190  AMP-dependent synthetase and ligase  49.73 
 
 
565 aa  578  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0730662  normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  48.83 
 
 
566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.503823  normal  0.180474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  48.03 
 
 
561 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4769  AMP-dependent synthetase and ligase  48.28 
 
 
563 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  47.24 
 
 
561 aa  561  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4195  AMP-dependent synthetase and ligase  47.05 
 
 
561 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0516  AMP-dependent synthetase and ligase  47.33 
 
 
561 aa  543  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0152867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0532  AMP-dependent synthetase and ligase  47.15 
 
 
561 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.51 
 
 
560 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.87 
 
 
560 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1265  AMP-dependent synthetase and ligase  46.77 
 
 
566 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  47.06 
 
 
559 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.75 
 
 
569 aa  525  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.57 
 
 
569 aa  523  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  47.06 
 
 
559 aa  521  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.4 
 
 
569 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.68 
 
 
566 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  46.51 
 
 
559 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.43 
 
 
557 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.43 
 
 
557 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  46.51 
 
 
561 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.79 
 
 
557 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.07 
 
 
557 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.97 
 
 
557 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.97 
 
 
557 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  45.62 
 
 
559 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.97 
 
 
557 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.8 
 
 
557 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 
559 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  45.63 
 
 
562 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  44.88 
 
 
565 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.62 
 
 
557 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.88 
 
 
566 aa  501  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  44.03 
 
 
561 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.62 
 
 
557 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.07 
 
 
557 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  43.77 
 
 
557 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1866  long-chain fatty acid-CoA ligase (AMP-binding)  45.49 
 
 
594 aa  491  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1867  long-chain fatty acid CoA ligase (AMP-binding)  46.18 
 
 
575 aa  488  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.805578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.82 
 
 
557 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.82 
 
 
557 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  44.75 
 
 
594 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.5 
 
 
573 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.66 
 
 
572 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.1 
 
 
557 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  43.77 
 
 
553 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  44.8 
 
 
572 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2156  AMP-dependent synthetase and ligase  46 
 
 
575 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.12 
 
 
558 aa  487  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  44.74 
 
 
588 aa  486  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.75 
 
 
557 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.87 
 
 
561 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.15 
 
 
557 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.68 
 
 
563 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 
557 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  45.36 
 
 
566 aa  484  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.63 
 
 
561 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.07 
 
 
561 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  43.87 
 
 
561 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  43.69 
 
 
583 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.87 
 
 
561 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.41 
 
 
557 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 
567 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.18 
 
 
555 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.69 
 
 
583 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  43.87 
 
 
561 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.12 
 
 
557 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.87 
 
 
561 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.87 
 
 
561 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.72 
 
 
572 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.36 
 
 
563 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.82 
 
 
557 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.87 
 
 
561 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 
554 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 
577 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.42 
 
 
557 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.01 
 
 
562 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.09 
 
 
566 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.01 
 
 
562 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.74 
 
 
557 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 
572 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.65 
 
 
581 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.34 
 
 
561 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.34 
 
 
561 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  44.8 
 
 
550 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.07 
 
 
557 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.93 
 
 
558 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.07 
 
 
557 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.34 
 
 
561 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.36 
 
 
572 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.99 
 
 
566 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 
647 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.34 
 
 
561 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.34 
 
 
561 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.82 
 
 
557 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.82 
 
 
557 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.89 
 
 
557 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.89 
 
 
557 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  44.98 
 
 
552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>