More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1190 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  86.02 
 
 
566 aa  1046    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.503823  normal  0.180474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1190  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
565 aa  1173    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0730662  normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4769  AMP-dependent synthetase and ligase  52.45 
 
 
563 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4195  AMP-dependent synthetase and ligase  51.52 
 
 
561 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0545  AMP-dependent synthetase and ligase  51.71 
 
 
561 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0516  AMP-dependent synthetase and ligase  50.09 
 
 
561 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0152867 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0532  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 
561 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  50.45 
 
 
561 aa  593  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1265  AMP-dependent synthetase and ligase  49.29 
 
 
566 aa  594  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.29 
 
 
560 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  50.36 
 
 
559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  50.36 
 
 
559 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.01 
 
 
560 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 
559 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.59 
 
 
569 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.77 
 
 
569 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.81 
 
 
561 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1183  AMP-dependent synthetase and ligase  49.73 
 
 
560 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.63 
 
 
563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.82 
 
 
572 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.91 
 
 
563 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.6 
 
 
569 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.47 
 
 
557 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.47 
 
 
557 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.65 
 
 
557 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.04 
 
 
560 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 
561 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  48.04 
 
 
565 aa  555  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.74 
 
 
557 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.47 
 
 
557 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  48.75 
 
 
559 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.47 
 
 
557 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  48.39 
 
 
566 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  47.86 
 
 
559 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.77 
 
 
567 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.76 
 
 
557 aa  549  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  48.31 
 
 
562 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.76 
 
 
557 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.47 
 
 
557 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.47 
 
 
557 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.94 
 
 
557 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  47.94 
 
 
553 aa  542  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  48.04 
 
 
557 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.47 
 
 
561 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.58 
 
 
557 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  48.12 
 
 
561 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.94 
 
 
557 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.76 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.94 
 
 
554 aa  537  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.12 
 
 
581 aa  535  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.94 
 
 
581 aa  538  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.76 
 
 
566 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.29 
 
 
566 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.94 
 
 
566 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.22 
 
 
561 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.22 
 
 
561 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.13 
 
 
573 aa  525  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.22 
 
 
561 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.22 
 
 
561 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.22 
 
 
561 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  46.22 
 
 
557 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.6 
 
 
577 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  47.04 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  47.04 
 
 
583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.04 
 
 
561 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  45.36 
 
 
558 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.04 
 
 
572 aa  518  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.04 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.04 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.04 
 
 
583 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.04 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.68 
 
 
562 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  47.04 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.68 
 
 
562 aa  518  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.34 
 
 
566 aa  512  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  44.6 
 
 
647 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  44.94 
 
 
572 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.86 
 
 
561 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  46.69 
 
 
567 aa  513  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  46.42 
 
 
569 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004090  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.25 
 
 
563 aa  510  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0450361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.4 
 
 
572 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2155  AMP-dependent synthetase and ligase  45.02 
 
 
594 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657551  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  44.96 
 
 
552 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01137  acyl-CoA synthetase (long-chain-fatty-acid-CoA ligase), acyl-adenylate activating enzyme  45.05 
 
 
550 aa  507  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00114592  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01379  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.89 
 
 
563 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.94 
 
 
572 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.29 
 
 
558 aa  499  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1866  long-chain fatty acid-CoA ligase (AMP-binding)  44.66 
 
 
594 aa  501  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  45.18 
 
 
588 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  45.96 
 
 
553 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1570  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45 
 
 
566 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000352834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0735  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.89 
 
 
560 aa  493  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.465816  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2193  AMP-dependent synthetase and ligase  45.29 
 
 
576 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.78 
 
 
557 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.09 
 
 
557 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  43.93 
 
 
558 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2409  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 
554 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0704611  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1867  long-chain fatty acid CoA ligase (AMP-binding)  43.67 
 
 
575 aa  481  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.805578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  43.85 
 
 
560 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>