93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1206 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1206  GPW/gp25 family protein  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3053  pyocin R2_PP, baseplate protein  78.7 
 
 		 108 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.273925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4045  GPW/gp25 family protein  75.47 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0346302  hitchhiker  0.000000000000617415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3401  baseplate assembly protein W  71.3 
 
 		 108 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0761  putative bacteriophage protein  69.44 
 
 		 108 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08020  putative bacteriophage protein  68.52 
 
 		 108 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215525  hitchhiker  0.000186329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1865  GPW/gp25 family protein  50.47 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0739  hypothetical protein  48.45 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1292  GPW/gp25  45.79 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.45738 
 
 
-
 
NC_002978  WD0282  prophage LambdaW1, baseplate assembly protein W, putative  46.39 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1622  baseplate assembly protein GpW  47.66 
 
 		 109 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2217  baseplate assembly protein W  41.12 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3301  GPW/gp25 family protein  49.4 
 
 		 123 aa  87.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37470  Phage P2 baseplate assembly gpW-like protein  42.99 
 
 		 117 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0892  GPW/gp25 family protein  41.51 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0640  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein W, putative  45.26 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.567056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1826  GPW/gp25 family protein  40.95 
 
 		 116 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00667674  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2853  baseplate assembly protein W  43.16 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3188  GPW/gp25 family protein  39.22 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1938  phage baseplate assembly protein  38.89 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3036  baseplate assembly protein W  41.05 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323923 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2764  GPW/gp25 family protein  39.36 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0937  baseplate assembly protein W  41.49 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00848  hypothetical protein  41.49 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2636  GPW/gp25 family protein  43.59 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.06569  hitchhiker  0.000477271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2602  GPW/gp25 family protein  43.59 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0538459  hitchhiker  0.000000000023308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00842  phage baseplate assembly protein  41.49 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2342  GPW/gp25 family protein  38.71 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2091  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0868  GPW/gp25 family protein  33.02 
 
 		 116 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.766869  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0193  GPW/gp25 family protein  44.05 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.361136 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1162  GPW/gp25 family protein  38.32 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0359  GPW/gp25 family protein  38.32 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0401  phage-related baseplate assembly protein  38.32 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1387  GPW/gp25  38.18 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2383  GPW/gp25  41.24 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0511478  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1140  phage-related baseplate assembly protein  38.32 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.282207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01345  phage-related baseplate protein  45.12 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224868  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4850  GPW/gp25 family protein  42.86 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4338  baseplate assembly protein GPW  36.46 
 
 		 115 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0101989 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2653  GPW/gp25 family protein  33.02 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0318041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2300  GPW/gp25 family protein  35 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2901  GPW/gp25 family protein  45.71 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.656518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3038  baseplate assembly protein GpW  36.46 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1924  phage baseplate assembly-like protein  37.5 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.245081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4378  baseplate assembly protein W  35.11 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.51911  hitchhiker  0.0000024213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1336  hypothetical protein  44.59 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.700535  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3332  GPW/gp25  39.18 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2297  GPW/gp25 family protein  41.89 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.292617  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4351  hypothetical protein  38.37 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0144836  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2184  baseplate assembly protein W  41.89 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3487  GPW/gp25 family protein  35.9 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0234  baseplate assembly protein W, putative  33.73 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.212907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2068  hypothetical protein  39.19 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105376  hitchhiker  0.0000449459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3824  GPW/gp25 family protein  40 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0284604  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3821  GPW/gp25 family protein  37.35 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2888  GPW/gp25 family protein  37.93 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1873  GPW/gp25 family protein  38.03 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.350092  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5382  GPW/gp25 family protein  37.65 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1574  GPW/gp25 family protein  36.78 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.442501  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26600  phage baseplate assembly protein W  39.44 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210293  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4136  GPW/gp25 family protein  32.98 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.588848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4391  GPW/gp25 family protein  41.67 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908149  normal  0.82195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0924  GPW/gp25 family protein  37.14 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.812377  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0767  GPW/gp25 family protein  35.21 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4539  phage baseplate assembly protein W  36.26 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.322308  normal  0.18204 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4540  baseplate  36.26 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4455  baseplate  36.26 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2268  GPW/gp25 family protein  36.84 
 
 		 139 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168277  hitchhiker  0.000399875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2908  prophage MuMc02, baseplate assembly protein W, putative  36.14 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1908  GPW/gp25 family protein  33.33 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00711774  hitchhiker  0.000781626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1866  Phage baseplate assembly protein W  33.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1511  GPW/gp25 family protein  38.24 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1726  GPW/gp25 family protein  32.86 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000162681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2890  hypothetical protein  36.62 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0668  GPW/gp25 family protein  28.38 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  36.23 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3157  GPW/gp25 family protein  28.79 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2947  GPW/gp25 family protein  33.85 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1499  GPW/gp25 family protein  30.3 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0588  GPW/gp25 family protein  32.47 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3929  GPW/gp25 family protein  32.31 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  normal  0.0232034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2815  GPW/gp25 family protein  30 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1665  GPW/gp25 family protein  28.75 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0986  tail lysozyme, putative  31.4 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0181495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1679  GPW/gp25 family protein  34.43 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1418  GPW/gp25 family protein  32.86 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1951  GPW/gp25 family protein  32.5 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.368797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0367  GPW/gp25 family protein  31.25 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0674  GPW/gp25 family protein  27.14 
 
 		 139 aa  42  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1135  GPW/gp25 family protein  36.36 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3001  GPW/gp25  30.65 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2552  GPW/gp25 family protein  32.79 
 
 		 147 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>